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目的:本研究应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛选出肺癌血清、肺泡灌洗液(BALF)和肺癌组织差异蛋白,找出蛋白与肺癌的关系,并探讨其意义。方法:应用SELDI-TOF-MS技术通过弱阳离子交换蛋白芯片(WCX-2芯片)分别检测20例肺癌患者和10例肺良性病变患者的血清、肺泡灌洗液(BALF)和肺组织匀浆中的蛋白质图谱,采用Protein Chip Biomarker SystemⅡ-C型蛋白质芯片阅读仪读取芯片信息,采用Ciphergen Protein Chip 3.2版本的分析软件自动采集数据,读取峰高值,获得蛋白表达图谱,进行统计学处理。用Biomarker Pattern软件分析NSCLC差异蛋白并初步建立诊断模型。通过盲筛进一步验证诊断模型。结果:肺癌患者与肺良性病变患者相比较,蛋白质有以下差别:(1)血清:发现20个有统计学差异的蛋白峰,其中肺癌患者血清中显著高表达蛋白质波峰有14个(P<0.05),质荷比(M/Z)分别是3270.07Da,4095.44Da,5309.20Da,5340.15Da,5852.02Da,5906.89Da,6436.01Da,6632.41Da,6933.33Da,7768.18Da,7973.40Da,8065.61Da,8691.12Da,8142.28Da;显著低表达蛋白质波峰有6个(P<0.05),M/Z分别是2014.68 Da,2137.45 Da,2280.16Da,2503.32Da,3588.92 Da,2090.78Da;采用Biomarker Pattern Software(BPS)对经过Biomarker Wizard Software获得的数据进行分析处理,通过选用M/Z为2090.77 Da和2503.31 Da的差异蛋白峰建立分类树模型,其诊断的灵敏度为90%,特异度为100%。盲筛验证结果显示,其灵敏度为90%,特异度为100%,粗符合率(crude accuracy,CA)为93.33%,Youden指数(Youdens index,γ)为0.9。(2)BALF:发现18个有统计学差异的蛋白峰,其中肺癌组BALF中显著高表达蛋白峰有4个(P<0.05),M/Z分别是7280.59 Da,7766.12Da,7824.82Da,11510.51Da;显著低表达蛋白质波峰有14个(P<0.05),M/Z分别是2368.58Da,2382.53Da,2618.62Da,3377.17Da,3448.29Da,3494.11Da,3512.82Da,4140.77Da,4996.49Da,5426.08Da,6925.46Da,10837.31Da,13160.91Da,12691.68Da。通过选用M/Z 2611.61 Da和3252.80 Da的差异蛋白峰建立分类树模型,其诊断的灵敏度为100%,特异度为100%。盲筛验证结果显示,其灵敏度为95%,特异度为100%,CA为96.67%,γ为0.97。(3)肺癌组织匀浆:发现11个有统计学差异的蛋白峰,其中肺癌组织匀浆中显著高表达蛋白质波峰有3个(P<0.05),M/Z分别是4230.06Da,5757.93Da,11497.18Da;显著低表达蛋白质波峰有8个(P<0.05),M/Z分别是2301.92Da,2315.62Da,2331.54Da,2488.96Da,3507.10Da,3525.91Da,4770.84Da,4742.71Da。通过选用M/Z为5757.92 Da、4742.71 Da的差异蛋白峰建立分类树模型,其诊断的灵敏度为90%,特异度为100%。盲筛验证结果显示,其灵敏度为90%,特异度为100%,CA为93.33%,γ为0.9。经平行试验(paralleltest),上述盲筛试验中,30例患者中有20例被判为肺癌患者,10例被判为肺良性病变患者。根据病理结果,20例肺癌患者中20例被准确判断,10例肺良性病变患者10例被准确判断,没有误判。结论:(1)SELDI-TOF-MS技术筛选出的肺癌患者相对特异的蛋白标记物,其灵敏度高、特异性好。(2)肺癌患者与肺良性病变患者血清存在20个有统计学差异的蛋白峰,BALF存在18个有统计学差异的蛋白峰,组织匀浆存在11个有统计学差异的蛋白峰。这些蛋白可能与肺癌的生物学特性有关。(3)三法联合应用诊断肺癌,其灵敏度、特异性均为100%。