高效重组且无筛选标记痘苗病毒天坛株载体系统的建立

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhuyanmei
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
痘病毒(Poxvirus)是一类基因组较大的有包膜的线性双链DNA病毒,包括天花病毒(Variola virus)、痘苗病毒(Vaccinia virus)和牛痘病毒(Cowpox virus)等。其具有非必需基因多,对外源基因的容量大(<25kbp)及胞质复制等特点,因此痘苗病毒或者其它类型痘病毒能够以载体的形式用于抵抗流感病毒(Influenza virus)、人类免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)等的疫苗构建;更重要的是,通过敲除痘苗病毒特定基因,使其具有肿瘤选择性和安全性,因此可以作为溶瘤病毒的载体成为肿瘤免疫治疗的新手段。以往的研究中获得重组痘苗病毒载体的主要方法包括传统同源重组、直接体外连接法、细菌人工染色体等。但是这些方法存在重组效率低,病毒纯化耗时长等弊端,严重阻碍了痘苗病毒载体在临床上的应用,因此,目前亟需高效重组痘苗病毒载体的技术方法。CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromic repeat)-Cas9 是一种gRNA引导Cas9蛋白对靶点切割的基因编辑技术,可以产生indel;同时也可以在提供携带病毒同源序列的重组质粒的基础上,产生同源重组,获得新的重组病毒,已成功用于哺乳动物细胞及多种病毒、细菌的基因编辑中。而痘苗病毒天坛株(Vaccinia virus Tiantan strain,VTT)是中国自主研发、世界卫生组织文献记载中成功用于预防天花的疫苗毒株,在消灭天花的过程中发挥了重要的作用,已作为中国防止天花再次出现的应急储备疫苗毒种。因此,本研究拟在痘苗病毒天坛株的基础上通过CRISPR-Cas9建立高效重组痘苗病毒载体系统。本研究首先对痘苗病毒基因组进行扫描分析,利用网站(http://www.e-crisp.o-rg/E-CRISP/)预测靶向痘苗病毒不同位点的多条gRNA,后续选择了 TK区进行高效重组技术方法的探索。为此,本研究通过瞬时转染gRNA-Cas9质粒或建立表达Cas9蛋白的稳定细胞系后,感染VTT并转入重组质粒pJ2R-EGFP,经过多轮病毒噬斑实验纯化、测序鉴定证明利用CRISPR-Cas9技术能够更高效率的获得重组病毒天坛株痘苗病毒载体。同时与传统的同源重组方法相比,此高效重组痘苗病毒载体系统的重组效率大大提高,据此本研究初步建立起高效重组痘苗病毒载体系统。在高效重组痘苗病毒载体系统的建立过程中,为便于筛选,引入了外源筛选标记基因。为了满足重组痘苗病毒实际应用的需要,需要删除重组病毒中的筛选标记。Cre-LoxP是一种利用Cre酶识别特异DNA序列(LoxP位点),使两个Loxp位点间发生多种形式基因重组的系统。据此,本实验构建带有LoxP位点的重组质粒,利用瞬时转染高效重组的方法获得带有LoxP位点的重组病毒,然后通过Cre酶删除重组病毒中的筛选标记,获得删除TK且无筛选标记EGFP的重组痘苗病毒载体。综上所述,本研究通过CRISPR-Cas9与Cre-LoxP技术建立起高效重组且无筛选标记的痘苗病毒天坛株载体系统,为其在疫苗载体构建、肿瘤免疫治疗等方面提供参考价值。
其他文献
鼠疫耶尔森氏菌(Yersiniapestis,简称“鼠疫菌”)是烈性传染病鼠疫的病原菌。鼠疫菌以跳蚤作为传播媒介,致病性很强,感染动物宿主后发病很快、死亡率高而且传染性很强。现今世界各地仍然存在许多鼠疫的自然疫源地,而鼠疫菌被用作生化武器以及多药物抗性菌株的产生是人类公共卫生安全的潜伏危机。鼠疫菌带有三个关键的毒性质粒:pCD1以及其由假结核耶尔森氏菌(Yersinia pseudotubecul
本文证明圆盘上面有外力不可压Euler方程组的光滑解的涡量梯度对时间可以达到二阶幂指数增长,就算外力不依赖于时间.Kiselev和Sverak对无外力情况已经得到同样的结果.在有外力的情况下本文要更小心地对速度场作估计才能得到结论,有外力不可压Euler方程组跟无粘性无热传导Boussinesq方程组有相似之处,其中的涡量方程都有外力项,希望通过研究前者得到研究后者的方法启示.
miRNA是一种由长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA分子,现已证明miRNA与多种肿瘤的形成有关,控制和抑制miRNA的形成可以降低肿瘤的形成,但miRNA在细胞内的表达量很少,目前miR
三维重建是计算机视觉领域中一个典型的视觉问题,其技术的研究一直是个热点,特别是基于二维图像的重建技术,因其低廉的价格、较高的精度和高灵活性等特点,更是吸引了众多的学
夏侧金盏花是一种毛茛目、毛茛科、侧金盏花属的一年生草本植物,含有抗氧化活性极高的虾青素。因此,从夏侧金盏花提取虾青素及其它天然化合物引起研究者的极大关注。虾青素具有很强的抗氧化活性,主要从雨生红球藻和其它水生动植物中提取获得,而从陆生植物中进行提取研究较少,夏侧金盏花作为虾青素的陆生植物来源,具有很大的研究潜力。本论文以陆生植物夏侧金盏花为研究对象,通过有机溶剂萃取的方式得到粗提物。对提取得到的虾
非线性耦合方程揭示了物理学、化学等许多领域一些重要的现象和特征。而探讨这些耦合方程的行波解对相关领域特征现象的研究和分析有着重要的意义。本文主要以(G’/G)-展开法
目的:通过测定不同冠脉病变的冠心病患者血小板分布宽度(PDW)、碱性磷酸酶(ALP)、纤维蛋白原(FIB)、嗜酸性粒细胞(EOS)的水平变化,分析PDW、ALP、FIB、EOS对冠脉病变的临床预
随着现代技术和机械工程的飞速发展,控制系统的研究应用得到了学者们空前的关注.在研究控制系统时,人们常常需要考虑和研究它们的稳定性分析和最优化问题等,而对于这些问题的研究,在许多情况下都可以转化为相应的Lyapunov矩阵方程的求解问题及对其解的上下界的估计问题.因此,对Lyapunov矩阵方程半正定解的研究及其应用得到了许多学者的关注,且在理论和具体应用上取得不少研究成果.本文利用矩阵的Krone
位于西太平洋暖池的巴布亚新几内亚地区是国际上重要的物质“源-汇”地区之一,而新不列颠海沟则是其中一个紧邻岛屿的狭长区域。海沟是一个十分独特的区域,拥有全球最深的水域(深渊区)、漏斗状的地形和极端的环境等。为了进一步了解和认识海沟,我们选取了近陆型的新不列颠海沟作为研究对象。本文对新不列颠海沟插管沉积物NBT01、NBT02、NBT03、NBT05、NBT06、NBT07、NBT10和三个表层沉积物
图分解是图理论中一个重要的研究课题,设H1,H2,H3,...H是G的边不相交子图,若每个子图都同构于H,且G的每条边恰好存在于某个H中,其中1≤i≤l,我们称G分解成H,记作H|G.完全图分解作为图分解的热点问题之一,引起国内外很多学者的关注,他们对完全图的分解问题进行了大量的研究,并取得了一系列的成果.本文讨论的是完全多部图的圈分解问题,主要探究完全等7部图(各分部集大小为m)存在边不相交长为