近年来,三九集团的财务危机、光大证券的乌龙指以及“毒胶囊”事件都显示了企业内部控制的失效,激发了理论界关于内部控制有效性的研究热潮,对内部控制有效性影响因素的研究是其重点。另一方面公司治理问题已经成为现代公司制企业的关键问题,对内部控制有效性发挥作用具有重要意义,而股权结构在公司治理结构的形成中起着基础作用,决定公司控制权的分配,基于此本文也将从公司治理的角度研究股权结构对内部控制有效性的影响。采用理论分析与实证检验相结合的方式试图找到股权结构对内部控制有效性的具体影响。本文首先对前人关于内部控制有效性、公司治理与内部控制的关系和股权结构对内部控制的影响方面的文献做了简单的梳理与述评,再根据前人的研究成果结合内部控制目标找到了衡量内部控制有效性的方法。其次从理论上分析了股权结构、公司治理和内部控制的关系,从公司治理的角度找到股权结构对内部控制有效性影响的理论基础:股权结构是公司治理结构安排的基础,而公司治理是内部控制有效执行的制度环境,最终股权结构从股东对经营者的控制、经营者对管理层的控制、管理者对员工的控制三方面制约和影响企业内部控制有效性。然后根据理论,把股权结构的相关变量作为解释变量、内部控制有效性作为被解释变量,选取了深市主板A股上市公司2013年的数据进行了相关实证检验,其结论为:股权集中度、股权制衡度与内部控制有效性正相关,机构投资者持股比例与内部控制有效性呈正相关关系;上市公司控股股东性质不能显著影响内部控制有效性水平;高管持股激励在我国还未发展到影响内部控制有效性水平的阶段。最后根据实证结论,结合我国的实际情况,从内部控制自身建设和股权结构方面提出了相关建议措施以整体提高我国上市公司内部控制有效性水平,促进我国经济健康发展。本文是从众多内部控制有效性影响因素中,选择股权结构进行研究,能够使我国上市公司从调整股权结构方面入手,优化公司股权结构,为上市公司建设内部控制、提高内部控制有效性提供理论参考,国家及相关政府监管部门等也可以依据其采取适合我国上市公司发展的政策措施,共同促进上市公司的健康发展,推动我国市场经济的繁荣发展。