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研究目的：评估已有肿瘤标记物对结直肠癌预后的影响,寻找新的结直肠癌预后预测因素,探索筛选肿瘤标记物的新方法。研究方法：第一部分：回顾性收集2003年至2009年期间573例在复旦大学附属肿瘤医院接受根治性手术的Ⅱ～Ⅲ期的结直肠癌患者,运用单变量及多变量分析研究患者术前CEA、CA19-9与生存间的关系。第二部分：回顾性收集2006年至2008年期间在复旦大学附属肿瘤医院接受根治性手术的Ⅱ、Ⅲ期结直肠癌患者的冰冻组织77例,石蜡包埋样本59例,运用real time PCR及免疫组化技术研究MYH11基因的表达与复发转移的关系。第三部分：选取20例2012年10月在复旦大学附属肿瘤医院接受根治性手术的结直肠癌患者的癌组织及配对正常组织,运用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术筛选潜在的肿瘤标记物。研究结果：第一部分：单变量研究显示肿瘤分化(p<0.001),组织学类型(p=0.010),淋巴结转移数(p<0.001), CEA水平p<0.001)和CA19-9水平(p<0.001)与患者的总生存有关,术前CEA和CA19-9都升高的患者预后最差,而术前CEA和CA19-9都正常的患者预后最佳(p<0.001)。在多变量研究中,淋巴结转移数(p<0.001)、 CA19-9(p=0.007)和术前CEA(p=0.022)是独立的预后预测因素。第二部分：在77例(34例复发转移、43例未复发转移)Ⅱ、Ⅲ期结直肠癌冰冻组织中,MYH11基因在未复发人群的mRNA表达水平显著高于复发人群(P=0.009)。在蛋白质水平的检测中也获得了相同的结果(P=0.002)。在对基因表达与各临床病理特征的相关性研究中,MYH11的蛋白表达与患者的临床病理特征均没有联系。在单变量分析中,结合患者预后随访资料进行的生存分析显示,神经侵犯(P=0.002)、脉管内癌栓(P=0.003)和MYH11基因蛋白表达(P=0.004)均与无病生存时间有关,MYH11基因低表达的患者其无病生存时间明显较对应的人群短。在多变量分析中,MYH11基因是Ⅱ、Ⅲ期结直肠癌患者独立的预后预测因素(P=0.030)。第三部分：6个特征峰：6727(p=0.005)、7953(p=0.003)、8589(p=0.044)、10319(p=0.027)、15138(p=0.015)、15876(p=0.010)在癌组织及正常组织中存在差异性表达,并具有潜在的诊断价值。结论：第一部分：术前CEA和CA19-9都是Ⅱ～Ⅲ其结直肠癌患者的独立预后预测因素,术前CEA和CA19-9都升高的病人预后最差。第二部分：MYH11基因可能是具有预测Ⅱ、Ⅲ期结直肠癌患者预后的潜在生物标记物,其低表达水平能够预示肿瘤的复发及转移。第三部分：MALDI-TOF MS技术可以用作分析结直肠癌组织的代谢差异并筛选新的肿瘤标记物。