【摘 要】
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系统发生学的研究已经有几十年的历史了。目前,大部分的研究都是基于DNA或者蛋白质序列进行系统发生分析的,并且针对不同物种演示它们的进化历史。这些方法最终都将产生一棵
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系统发生学的研究已经有几十年的历史了。目前,大部分的研究都是基于DNA或者蛋白质序列进行系统发生分析的,并且针对不同物种演示它们的进化历史。这些方法最终都将产生一棵系统发生树,树的节点代表物种,而节点间的连边代表物种间的进化关系。由于基因序列数据的不足,通过分析不同物种的代谢网络可以更深层次的发现这些物种的进化和类别关系。代谢网络的拓扑结构可以用酶图来表示,本文提出一种新的酶图间距离的计算方法,用图的顶点间相似度和图的结构关系来定义图的距离。使用这样的方法,可以比较包含一类网络或一组网络的不同物种,得到的距离矩阵可以用来构建系统发生树。在不同物种的柠檬酸代谢网络中应用这种方法,实验得到的系统发生树与真实的结果十分接近,而且还能显示它们的进化关系。
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