【摘 要】
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目的:家族性肺癌(FLC)占肺癌总体发病率的8%。既往研究表明一些胚系突变可能导致了肺癌患病风险的增加。因此基于肿瘤胚系突变的研究为肺癌患者的早期筛查和个性化治疗方案提供了新的选择。本研究的目的是在于探究家族性肺癌患者共有的胚系突变以及对其致病性的研究。方法:为了探究与家族性肺癌相关的体细胞和胚系突变,我们对一个被诊断为肺腺癌(LUAD)的家庭中的三个姐妹的肿瘤组织,癌旁正常组织以及外周血样本进行
【基金项目】
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吴阶平医学基金(320.6750.2020-17-7)
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目的:家族性肺癌(FLC)占肺癌总体发病率的8%。既往研究表明一些胚系突变可能导致了肺癌患病风险的增加。因此基于肿瘤胚系突变的研究为肺癌患者的早期筛查和个性化治疗方案提供了新的选择。本研究的目的是在于探究家族性肺癌患者共有的胚系突变以及对其致病性的研究。方法:为了探究与家族性肺癌相关的体细胞和胚系突变,我们对一个被诊断为肺腺癌(LUAD)的家庭中的三个姐妹的肿瘤组织,癌旁正常组织以及外周血样本进行了全外显子测序。随后,我们利用GEO数据库中的单细胞RNA测序数据(sc RNA-seq)和TCGA数据库中转录组测序数据以探究特定胚系突变基因在肺腺癌组织及细胞层面的表达水平及预后情况。结果:我们首先在3例家族性肺癌患者中发现了七个共同的胚系突变,分别为ATR c.7667C>G(p.Thr2556Ser),SMG5 c.1933A>G(p.Lys645Glu),RAB3GAP2c.3143A>G(p.His1048Arg),EI24 c.122G>A(p.Arg41His),XDH c.2794G>A(p.Ala932Thr),PTPRA c.2017G>A(p.Val673Ile),GSTZ1 c.94G>A(p.Glu32Lys)。随后我们对着七个候选胚系突变进行了突变致病性分析,其中共济失调毛细血管扩张和Rad3相关蛋白(ATR)基因C.7667C>G(p.T2556S)突变被认为是最有可能导致家族性肺癌的候选突变。随后对于肺癌组织及癌旁样本的全外显子测序分析显示,该家族中患有肺腺癌的三姐妹表现出相似的体细胞突变模式。除了ATR突变外,我们还在5个肿瘤样本中发现了表征肺腺癌的常见突变基因(BRCA1、EGFR和ROS1)。接下来,我们利用了TCGA数据库探究了ATR在肺腺癌中的表达及预后情况,其结果显示ATR的表达在肺腺癌患者中显著下调且下调的ATR往往提示着不良的预后结局。通过GEO数据库中单细胞测序数据集GSE131907我们进一步分析了ATR在肺腺癌患者细胞层面的表达差异性,我们发现肿瘤患者与正常患者相比,免疫细胞中ATR的表达水平较高,而基质细胞中ATR的表达却相反。最后,我们分析了2706名中国肺腺癌患者的全外显子测序数据并总结了中国肺腺癌队列中的胚系突变规律。我们筛选出27个存在胚系突变的基因并列出它们的突变频率和突变位点。其中包括了比较常见的突变基因,例如:MLH1(1.03474%)、BRCA(0.77605%)、STK11(0.62823%)、CHEK2(0.44346%)、TP53(0.44346%)。同时,我们还揭示了这些胚系突变的多个突变位点,例如,我们在MLH1的胚系突变中检测到3个不同的突变位点,包括c.649C>T(p.R217C)、p.Q701K(c.C2101A)和p.V384D(c.T1151A)。结论:我们在一个受家族性肺癌影响的中国家庭的三个姐妹中发现了ATR基因的胚系突变,这可能是肺癌易感性的遗传因素。
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