RNF168在食管鳞癌中的表达与预后相关性及Wnt/β-catenin信号通路的实验研究

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背景:食管癌的发病率和死亡率较高,即使可以通过积极的治疗其五年生存率仍然很低,目前我国关于食管癌的靶向药物治疗的研究发展越来越多,RNF168虽在部分其他肿瘤中报道,但食管鳞癌相关问题研究方法仍然很少。目的:探究RNF168在食管鳞状细胞癌中的表达情况,和它的异常表达与临床病理学特征之间的联系,并通过敲减RNF168的表达进一步观察食管癌细胞恶性行为的变化。方法:1.通过加权共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)对TCGA数据库的94例食管鳞癌样本进行分析,并筛选出枢纽基因。2.分析TCGA数据库(癌症基因组图谱),探讨RNF168在食管鳞癌与对应正常组织中的表达并分析;3.甘肃省人民医院食管鳞状细胞癌患者的相应的临床数据,癌组织和癌旁组织切片通过免疫组织化学方法,临床病理的关系分析的结果染色收集活检。4.利用慢病毒转染食管癌细胞构建RNF168低表达组与实验组,转染成功并得到稳转细胞株后进行功能试验,CCK-8法验证细胞增殖、细胞划痕试验与Transwell小室验证细胞迁移、流式细胞术验证细胞凋亡情况。5.相关蛋白表达利用Western blot、mRNA表达情况利用实时定量PCR。6.分析TCGA数据库进行功能富集分析与通路富集分析预测相关功能与下游通路,利用R软件对TCGA数据库中的184例食管癌患者数据进行分析。7.相关统计学利用SPSS21.0进行。结果:1.通过WGCNA发现,RNF168为食管鳞癌T分期相关的枢纽基因;2.分析TCGA中RNF168在mRNA水平的表达情况,结果得出,RNF168在食管鳞癌中呈高表达,差异有统计学意义(P<0.05),其中RNF168的表达水平与stage分级呈正相关,表达水平越高,分级越靠后;3.免疫组化结果显示RNF168在癌组织高表达并且与性别、年龄、分化程度、肿瘤长度、淋巴结转移及是否有远处转移无明显相关性,但与分期、浸润深度相关(P<0.05)。Linkedomics数据库检测RNF168 mRNA与ESCC临床病理特征的关系,结果得出RNF168的表达水平在病理分期上具有统计学差异(P=0.004,N=162),但在远处转移M分期差异无统计学意义(P=0.92,N=144);4.通过慢病毒转染抑制食管癌细胞中RNF168的表达得出,敲减RNF168后的食管癌细胞的增殖较对照组细胞受到抑制(P<0.01)。实验组细胞较对照组细胞的凋亡增加了(P<0.01)。细胞划痕实验结果得出细胞运动能力受到抑制(P<0.01),Transwell小室实验得出实验组细胞的迁移能力受到抑制(P<0.01)。5.通过GSEA富集能力分析可以得出一个主要功能富集,在富集的生物学过程中我们主要内容包括颅脑系统发育、微管组织中心定位、细胞间Wnt信号通路以及DNA双链断裂修复等相关,涉及的细胞成分研究包括染色体以及DNA损伤位点等。6.通过分析TCGA食管鳞癌患者数据得出,RNF168与WNT3A表达异常影响患者生存时间(P<0.05)。结论:1.RNF168在人食管鳞癌中高表达,并且与肿瘤浸润深度及病理分期相关,表明RNF168可能作为预测食管鳞癌恶性程度的生物标记物。2.我们的数据还表明,RNF168的抑制可以影响食管癌细胞增殖、及细胞运动,并可以调控Wnt/β-catenin信号通路。因此,RNF168是一个很有前途的生物标记物,为食管鳞癌的治疗提供了潜在的治疗选择。
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