目的：了解新疆包虫病外科救助项目中27家医院的包虫病患者住院费用的变化和构成，分析疾病的经济负担，分析和探讨其主要影响因素，为包虫病治疗和卫生决策者的工作提供参考依据。方法：按照纳入和排除标准，将包虫病外科救助项目27级医院自2008年6月至2013年12月患者的基本信息，治疗病案信息、申请材料、费用报销凭证和治疗的费用等数据整理分析，计算直接经济负担,利用SPSS19.0对数据进行统计描述，方差分析、多元逐步回归等，利用DALY(伤残调整生命年，Disability Adjusted Life Year)与人力资本法结合的方法中推荐的生产力权重加权求和估算间接经济负担。结果：27家外科救助项目定点医院共调查包虫病患者2544人次，人均直接医疗费用14286.52元，人均直接非医疗费用为1451元，省级医院的住院费用28070.35，高于地州级医院14156.06元，县级医院最低10040.53元；人均直接经济负担为15737.52元；人均间接经济负担用人力资本法与DALY相结合的方法估算人均间接经济负担为2341.32元，45-60岁的患者间接经济负担最重，人均6219.60元。人均总经济负担为18078.84元。县级医院直接医疗费用人均10043.65元，影响因素有年龄、医保、并发症和职业；直接非医疗费用6054.55元，哈萨克族患者最多。结论：新疆包虫病的经济负担较重，不同等级的医院应制定相应的中央补助政策，不同的年龄阶段应有相应的策略，政府广泛宣传包虫病的防治教育，加强包虫病的预防，采用多种途径降低患者的住院日，减少住院费用，加大政府的财政投入，完善医保政策，减轻患者经济负担。DALY与人力资本法结合的方法估算间接经济负担是目前较为合理的一种评估方法。