人源E3泛素连接酶ARIH1的激活态结构初探

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:doudou2008
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
泛素化是真核细胞中普遍存在的蛋白质翻译后修饰现象,具有介导蛋白质降解、定位、激活等多种功能。泛素化过程由一系列酶催化,E3泛素连接酶是直接介导泛素向底物蛋白转移的酶,在泛素化的特异性方面发挥重要作用。人类存在600多种E3,调控成百上千种底物蛋白的泛素化,参与广泛的生命活动。HECT型、RING型和RBR型是泛素连接酶E3的三大类型,其中RING型E3研究最多,对其机制的了解也最为深入,而RBR型E3则是最晚发现且了解最少的。RBR型E3中具有Ariadne特征结构域的成员组成了Ariadne RBR E3亚家族。Human homolog of Drosophila Ariadne-1(ARIH1)是果蝇中ariadne-1的人类同源蛋白,属于Ariadne RBR E3类。在本文之前,已有研究表明:1)ARIH1单独存在时,其具有催化活性的位点由于被Ariadne结构域掩埋导致无法执行泛素转移功能,因此处于自抑制状态;2)当ARIH1与经过类泛素蛋白NEDD8修饰的Cullin-RING E3 ligases(CRLs)结合时,其自抑制状态解除,E3酶活性被激发。然而,激活态结构和激活分子机制尚未可知。本课题对NEDD8-CRL-ARIH1-Ubch7-Ub蛋白复合体的结构生物学研究进行了初步的探索:1)我们通过构建不同的重组质粒,分别探索了在原核/真核表达系统中以及单独表达/共表达方式下的蛋白表达情况,最终选用了更为高效的原核、单独表达纯化方式获得组分蛋白;2)在此基础之上,通过筛选纯化标签和优化纯化步骤,我们得到了纯度与产量均符合基本要求的蛋白样品;3)分别验证了CUL1、2、3、4A均具有体外类泛素化活性;4)通过分子筛成功验证了CRLs与ARIH1间具有强相互作用,并且通过蛋白截短验证了CRLs的CTD与ARIH1互作至关重要;5)体外验证了复合体具有自泛素化活性,同时也对蛋白复合体样品进行了进一步的晶体学筛选,遗憾的是,由于复合体组分众多且较为动态,结晶难度大,一直未筛选到合适的可结晶条件。本研究虽然未能得到NEDD8-CRL-ARIH1-Ubch7-Ub蛋白复合体的晶体,但对该蛋白复合体的样品制备方式进行了优化,为后续开展复合体动态结构表征研究提供了一定的基础。
其他文献
由于传统的污水处理厂建设及维护成本过高,而地方财政综合能力有限,在我国经济发展相对较慢的中小城镇及农村地区,大量未经处理的养殖废水及生活污水直接排入河流、湖泊,导致受纳水体富营养化加剧,造成水质恶化、透明度下降、水生高等植物消失等系列生态环境问题。因此,探索可靠、稳定、经济实惠的农村生产、生活污水处理技术,已成为推动我国农村绿色产业发展、促进新农村建设亟待解决的关键性问题。相较于传统的污水处理技术
土壤分类对土壤科学的发展具有引领作用。剖面内各层次是研究土壤分类的基础,通过原位发生层划分采样和实验室诊断层与诊断特性理化分析鉴别,能够对土壤进行分类。而传统的发生层划分是一种定性划分方法,依赖调查人员的主观经验知识,缺乏定量划分标准,难以得到一致的分层结果。实验室理化分析耗时耗力,且对土壤样品有较高要求,无法满足快速高效识别土壤诊断层的现实需求。因此,本文基于快速获取的土壤属性数据,开展土壤数值
本文主要研究高阶Schr?dinger方程的逆散射问题.首先我们利用构造复几何光学解的方法证明了高阶Schr?dinger方程逆散射问题的唯一性结果,进一步,我们证明了散射矩阵的部分信息也能局部唯一的确定位势,即反向逆散射问题的局部唯一性,并且我们改进了二阶Schr?dinger方程反向逆散射问题中位势的条件.本文总共由五章构成.第一章介绍Schr?dinger方程以及逆散射问题的物理数学背景,并
为了适应地球自转形成的昼夜交替,生物在长期进化中形成的计时系统被称作“生物钟”(circadian clock)。生物钟失调可能会引起诸多疾病,例如:睡眠障碍、炎症性肠病、心血管疾病和癌症等。真核生物的生物钟核心振荡器都是由基于转录-翻译负反馈调节环构成的。在粗糙脉孢菌中,转录激活因子WC-1和WC-2形成的复合物作为正调控因子,而生物钟蛋白FRQ及其互作蛋白FRH作为负调控因子。在小鼠中,生物钟
目的 分析人工智能(AI)在儿童骨龄X线影像诊断中的应用价值。方法 选择2020年4月至2021年1月期间广东医科大学顺德妇女儿童医院儿童保健科提供的需要X线骨龄诊断的120例儿童左手骨龄片。邀请2名高年资、经验丰富放射科诊断医师采用Greulich-Pyle手腕骨骨龄图谱法(GP图谱法)对儿童左手骨龄进行评测,作为标准组;实验组采用AI评测骨龄,参考标准,比较两组骨龄评测时间,两组左手骨龄、左手
柑橘是世界第一大果树,无核是其作为鲜食水果的优良经济性状之一,而雄性不育是导致果实无核的重要原因。因此,雄性不育机理研究是柑橘品种无核化改良的重要前提。雄性不育胞质杂种‘华柚2号’(G1+HBP)是以胞质雄性不育品种‘国庆1号’温州蜜柑(G1)和可育品种HB柚(HBP)为亲本经原生质体融合创制,遗传上相当于其可育亲本HBP的雄性不育突变体,是研究柑橘雄性不育的理想材料。本研究以‘华柚2号’和HB柚
对称性是物理学中最重要的基本概念之一,PT对称光学系统及其相关应用的研究已经成为非线性光学和量子光学等相关学科领域的前沿问题并取得了许多激动人心的进展。近年来,伴随着光学微腔结构特别是光力系统的发展,PT对称的微腔系统已经在实验上实现并且观测到了一系列传统结构所不能实现的光学效应。PT对称结构相比于传统结构根本的区别就是在于它具有增益,而增益可以用于补偿系统的耗散,并且可以提高腔的品质因子,以致于
细菌生物膜是细菌等病原体在某些不利条件下形成的特殊复合体。与游离的病菌不同,生物膜由于具有丰富的细胞外基质并紧紧的粘附于复用医疗器械及组织表面,传统的抗生素等理化治疗手段很难有效的由外而内作用到菌体本身,此外也造成了外伤难以愈合及植入物排异等医疗方面的不良后果。金属有机框架材料MOFs(Metal-Organic Frameworks)具有非常高的孔隙率、广泛的催化性能以及化学稳定性等优良特性,广
当前水体磷污染问题日益突出,严重威胁着生态安全和人类健康。生物炭作为一种稳定的多孔芳构化炭质材料,具有良好的吸附能力,用于磷回收,不仅能“以废治废”,负载磷后的生物炭还可生产炭基缓释肥,用于节肥改土,增加碳汇,实现磷、碳的生态循环。但现有工程生物炭用于磷回收仍存在吸附负载容量偏小、吸附效率不高等技术瓶颈,极大地限制了该技术的推广应用。通过对生物炭进行钙、氮杂原子缺陷结构构筑,改变生物炭表面吸附活性
第一部分ITK-SYK融合基因过表达载体构建以及细胞转染目的:ITK-SYK是非特指外周T淋巴瘤中最新发现的一种融合基因,对外周T淋巴瘤的发生发展有着重要作用。我们通过构建ITK-SYK融合基因的过表达慢病毒载体,转染Jurkat细胞使其表达SYK融合蛋白。同时观察慢病毒载体感染Jurkat细胞后的生物学行为变化。方法:用PCR方法分别扩增ITK,SYK基因片段,然后采用Fusion PCR方法将