目的：采用组织芯片技术研究跨膜丝氨酸蛋白酶2-ERG融合基因(TMPRSS2-ERG)、甲酰基辅酶A消旋酶(P504s)在不同前列腺组织中的表达情况,分析其临床意义。　　方法：制作63例前列腺疾病组织芯片,其中前列腺癌(PCa)30例、前列腺增生(BPH)23例、高级别前列腺上皮内肿瘤(HGPIN)10例,分别用免疫组化S-P法和荧光原位杂交(FISH)法检测P504s蛋白和TMPRSS2-ERG融合基因的表达情况。　　结果：P504s、TMPRSS2-ERG在PCa中高表达,阳性率分别为86.7％、70%,而BPH对照组中不表达或低表达,差异有显著的统计学意义(P<0.01)。TMPRSS2-ERG融合基因在PCa中稳定高表达,不受血清PSA大小、Gleason评分高低及TNM分期的影响(P>0.05),TMPRSS2-ERG和P504s的阳性符合率随P504s信号增强而增强,最高达83.3%(15/18),阴性符合率为75%(3/4)。在BPH和PCa的检测中,TMPRSS2-ERG融合基因阳性表达的特异性为100%(23/23),敏感性为70%(21/30),而TMPRSS2-ERG与P504s联合检测的总体特异性和敏感性均为100%。　　结论：在PCa诊断中TMPRSS2-ERG融合基因可作为独立检测因子,联合检测TMPRSS2-ERG和P504s可以在基因和蛋白两个层面对PCa做出更加稳定可靠的早期诊断。组织芯片技术使免疫组化和FISH成为高效准确的检测手段,其在病理研究和疾病诊断中有重要价值。