摘要 本研究以15个牛微卫星位点研究了贵州省5个地方山羊品种（类群）的遗传多样性，与邻近的马头山羊、云南昭通山羊的遗传关系，并预测波尔山羊与这些地方品种的杂种优势，结果：15个牛微卫星位点中，13个位点在试验山羊中有扩增产物，检出率为86.67％（13/15），8个多态，多态位点检出率53.33％（8/15），可分析的多态位点6个，占40％（6/15），反应了微卫星位点在牛羊之间具有较高同源性；贵州白山羊（含有角和无角类群）、贵州黑山羊、黔北麻羊、榕江小香羊及毗邻的马头山羊、云南昭通山羊大多数位点处于哈代温博不平衡，其原因，外来品种及地方品种间的杂交，样本小； 贵州地方山羊品种（类群）比马头山羊、云南昭通山羊、波尔山羊具有较高的遗传多样性，高低顺序是贵州白山羊无角类群（W）>贵州白山羊有角类群（G）>贵州黑山羊（H）>黔北麻羊（Q）>马头山羊（M）>榕江小香羊（R）>昭通山羊（Z）>波尔山羊（B）；群体遗传分化大，群体变异主要存在于品种（类群）内，而品种（类群）间的变异较小；贵州地方品种（类群）在INRA063、ILSTS030、INRABERN192、RM088等4个位点，各有1-2个特色基因，但频率都较低，是否可以作为一个品种某种特征的潜在标记，需要扩大样本量进一步研究；贵州白山羊与贵州黑山羊遗传距离最近，其次是榕江小香羊，与黔北麻羊最远；马头山羊与贵州白山羊和榕江小香羊的遗传距离较近；云南昭通山羊与黔北麻羊的遗传距离最近；在贵州4个地方山羊品种与马头山羊、昭通山羊的系统进化中，黔北麻羊和昭通山羊组成一支，贵州白山羊、贵州黑山羊、榕江小香羊和马头山羊组成另一支，这与它们的地理分布及品种形成相符，两支的分化先后有待深入研究；预测波尔山羊与贵州白山羊、马头山羊杂交，后代杂种优势最大。