LINGO基因家族与原发性震颤的相关性研究

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目的系统性分析湖南省汉族原发性震颤(essential tremor,ET)患者LINGO1基因(the leucine-rich repeat and1g domain containing nogo receptor-interacting protein1gene)全部编码区的基因变异,分析这些基因变异在湖南省汉族人群中的基因型和等位基因的变异频率,探讨LINGO1基因是否与湖南省汉族ET发病相关。方法运用聚合酶链式反应-单链构象多态方法(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)对100例ET患者进行LINGO1基因全部编码区的遗传学分析,用直接测序法确定变异基因型。在151例ET患者(包括最初检测的100例患者)和301例性别、年龄和种族相匹配的正常对照者中对检测到的基因变异进一步分析基因型和等位基因分布的频率差异。结果1.对100例ET患者采用PCR-SSCP和直接测序突变检测后,我们发现了4个LINGO1基因变异(rs2271398,rs2271397,1个新的G>C碱基替换ss491228439和rs3743481),4个变异均为同义突变,预测既不改变氨基酸也不改变剪切位点。2.在151例ET患者和301例性别、年龄和种族相匹配的正常对照者中进行全部4个基因变异(rs2271398,rs2271397,ss491228439和rs3743481)基因型频率和等位基因频率的分析,并没有发现统计学差异(All P>0.05)。但在随后的性别分层分析中发现rs2271397和ss491228439的C等位基因是女性ET患者发病的危险因素(rs2271397:P=0.017,OR:2.139,95%CI1.135~4.030;ss491228439:P=0.038,OR=1.812,95%CI1.027~3.194),且单体型分析也发现A465-C474-C714单体型与女性ET患者发病相关P=0.041,OR=1.800,95%CI1.020~3.178),其野生型G465-T474-G714单体型对患者发病起保护作用P=0.023,OR=0.484,95%CI0.256~0.915).结论LINGO1基因可能与湖南省汉族女性ET发病相关。目的检测湖南省汉族原发性震颤(essential tremor,ET)患者LINGO4基因(the leucine-rich repeat and1g domain containing nogo receptor-interacting protein4gene,LING04)的基因变异,分析这些基因变异在湖南省汉族人群中的突变频率,探讨LING04基因是否与ET发病有关。方法运用聚合酶链式反应-单链构象多态方法(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)对100例ET患者进行LING04基因编码区的遗传学分析,并用直接测序法确定这些变异的基因型。在150例患者(包括最初检测的100例患者)和300例性别、年龄和种族相匹配的正常对照者中对检测到的变异进一步分析突变频率差异。采用生物信息学软件Mutation Taster对错义突变进行疾病预测。结果1.对100例患者突变检测后,我们发现了2个LINGO4基因变异(rs61746299和rs1521179)。rs61746299是错义突变,为T>A碱基替换,位于第2号外显子,预测引起第444位氨基酸由苏氨酸转变为丝氨酸(Thr444Ser).另1个变异rs1521179位于编码区下游12bp,预测不改变剪切位点。2.在150例ET患者和300例性别、年龄和种族相匹配的正常对照者中进行全部2个变异位点(rs61746299和rs1521179)基因型频率和等位基因频率的分析,并没有发现统计学差异(All P>0.05)。随后在家族性ET组、散发性ET组、早发型ET组和晚发型ET组的分层比较中也没有发现统计学差异(All P>0.05)。3.生物信息学软件Mutation Taster对错义突变进行疾病风险的预测分析,发现rs61746299苏氨酸到丝氨酸的变异为多态。结论LINGO4基因可能不是湖南省汉族ET的致病基因或易感基因。
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