扬子鳄捕食和非捕食期胃内细菌多样性比较分析研究

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本文以扬子鳄作为对象,运用宏基因组技术分析扬子鳄胃内细菌多样性及宏基因文库构建,了解扬子鳄食性特点及不同时期胃内细菌种群差别。  在采集10条不同时期扬子鳄胃内容物的基础上,通过提取胃内细菌总DNA扩增16SrDNA、构建宏基因组文库并测序,利用生物信息学进行分析。结果显示,在扬子鳄胃内共发现来自27个门的细菌,共有547个属的细菌,其中未知菌151种。捕食期与非捕食期扬子鳄胃内菌群差异性显著,非捕食期胃内菌群具有更高的丰富度和均匀度。刚孵化出的幼鳄其胃内已存在大量细菌菌群,且具有很高的物种丰富度和均匀度。在一年中胃内菌群的相似性与鳄鱼所处的不同时期有着一定的连续,但冬眠前期和即将结束冬眠的扬子鳄,其胃内菌群相似性并不高。同时,在各个时期的扬子鳄胃内均发现大量的致病菌,开展对扬子鳄致病菌的研究有利于对扬子鳄的防疫、防病与保护。
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