再生水是指城市污水经充分可靠的净化处理后，满足特定使用途径的水质标准的处理水。它具有应用范围广泛，经济成本低等特点，是实现水资源可持续利用的重要手段之一。本研究以北京市某再生水厂内再生水灌溉的草坪灌区与自来水草坪对照灌区为研究对象，运用统计学和微生物生态学分析方法研究了再生水灌溉对土壤和微生物系统的影响，在此基础上，分析再生水灌区土壤理化性质和微生物之间的关系，为制定再生水灌溉的可行性和安全性标准提供依据。对再生水灌区土壤进行11项理化指标的测定，分析了再生水灌溉下土壤理化性质的变化特征。结果表明：除了再生水灌区的全磷含量、碳氮比值及速效钾含量全部低于自来水灌区外，其余指标均表现出不同的规律。土壤含水量、有机质、有机碳、全氮、全钾含量的最大值均在再生水灌区的进水口处，高于自来水灌区。曝气池处的pH值最大，高于对照区，进水口处最小。进水口处碱解氮含量最大，出水口处同对照区数值相同，曝气池处最小。速效磷含量在曝气池处和进水口处数值均大于对照，最大值位于进水口处。对于再生水灌区土壤中的可培养微生物，采用稀释涂布平板法，分离共得到62株细菌，64株放线菌，40株真菌。将所筛选的细菌进行形态学鉴定，并根据《伯杰细菌鉴定手册》第八版的鉴定结果表明：优势类群有2类：芽孢杆菌属（Bacillus）、假单胞菌属（Pseudomona），共占总个体数的46.97％；常见类群有18类，共占总个体数的53.03％。研究结果表明，与自来水灌区相比，土壤经再生水灌溉后，一些稀有物种优势度增加，也有一些物种优势度降低。曝气池处菌株数最多，进水口处菌株数最少。从3项物种多样性指数发现不同理化性质的土壤微生物种群多样性的差异较大，相似程度较低。通过相关性分析，多样性指数、丰富度指数和均匀度指数有着密切的关系，对物种群落特征具有一致性的反映。对再生水灌区土壤微生物群落与pH、含水量（Soil moisture）、有机质（OM）、全氮（TN）、全磷（TP）、全钾（TK）、C/N、碱解氮（AN）、速效磷（AP）、速效钾（AK）等理化指标进行典型对应分析（CCA）。结果表明，土壤有机质(OM)、全氮(TN)、全磷(TP)三个指标是再生水灌溉地区土壤微生物群落结构影响的主要环境因子。