周围神经MicroCT图像中神经束分割的标准化流程研究

来源 :广东工业大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:q4828079
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
周围神经损伤可导致严重的瘫痪和神经功能障碍,是临床上的常见疾病。周围神经中神经束的三维(3D)可视化技术可提供详细的周围神经内部的空间信息,在周围神经损伤修复术中根据此信息选择合适的临床手术方案去修复周围神经损伤,这很有可能恢复神经的传导和控制功能。因此,周围神经中神经束的3D可视化技术一直是该领域的研究热点。周围神经Micro CT图像中神经束的轮廓信息是周围神经3D重建和可视化的基础。采用不同染色方法(例如无染色或饱和氯化钙染色)获取的周围神经标本经过Micro CT扫描后得到的图像,其前景和背景有很大的不同。这些图像在采用常规方法获取神经束轮廓时,需要采用不同的特征提取和识别方法,费时费力,且获得的神经束轮廓一致性不佳。因此,本文针对饱和氯化钙染色、无染色方法获得的两种周围神经Micro CT图像,研究如何进行神经束的标准化分割流程,目的在于无论采用何种染色方法获得的周围神经Micro CT图像均可在标准化流程下自动进行神经束轮廓获取。本文得到广东省自然科学基金项目(编号:2018A0303130137)、广东省高性能计算重点实验室开放项目(编号:TH1528)和国家自然科学基金项目(编号:61975248)的资助。本文的主要工作如下:1.目前不同染色方式获取的周围神经Micro CT图像,需要采用不同的神经束轮廓获取方法。因此,本文提出了周围神经Micro CT图像中神经束分割的标准化流程,使不同染色方法获得的不同尺寸的神经断层扫描图像在统一框架下实现神经束轮廓获取。2.构建图像数据集。对冻干无染色、饱和氯化钙染色两种染色方式制备的周围神经Micro CT图像,进行图像标注、分组等操作。然后将图像数据集分为三个子集,即无染色的图像数据集(子集1),氯化钙染色的图像数据集(子集2)和混合图像数据集(子集3)。3.对原始的Mask R-CNN算法中特征提取部分的网络结构进行改进。提出了一种密集连接型网络结构提取神经束的区域特征,实现多层特征之间的传递,更充分的复用提取到的特征,简称为改进1算法。4.在改进1算法的基础上,对Mask R-CNN算法中目标检测部分候选框的得分评价规则进行改进。降低算法的漏检率,简称为改进2算法。5.在改进2算法的基础上,结合迁移学习策略对Mask R-CNN算法的训练方式进行改进。提高神经束分割准确度,简称为改进3算法。6.提出了用分割精细度阈值对分割精度进行评价,并探索了周围神经Micro CT图像中获取神经束轮廓过程中精细度阈值的最佳取值。实验结果表明:(1)本文提出的标准化流程对于两种染色方式获取的周围神经Micro CT图像都有较好的分割效果,准确率均在83%以上,交并比均高于87%;(2)在图像特征较为复杂的无染色方式获取的周围神经Micro CT图像中,3个改进算法可逐步提高算法的准确率和交并比,且本文所提出的改进3算法的提高效果最显著,具有收敛速度快、训练效果好、准确率高的特点,最适合于由无染色方式获取的周围神经Micro CT图像中神经束轮廓的获取任务;(3)在训练集图像数量较少但神经束轮廓具有一定规律的氯化钙染色方式获取的周围神经Micro CT图像中,原始的Mask R-CNN算法与3个改进算法的准确率和交并比均在90%以上,且对于精细度阈值的改变具有一定的稳定性。其中改进1算法,在精细度阈值较高时,交并比最高,具有更好的轮廓获取精细度;(4)在两个子集中,改进3算法的准确率与交并比曲线在精细度阈值为0.85时相交。此时,可以较好的平衡准确率与交并比两个评价指标。该发现尚属首次。综上所述,针对不同染色方法获得的周围神经Micro CT图像,采用本文的标准化分割流程可以准确、快速、全自动获取神经束轮廓。
其他文献
高校教师是高等教育发展的核心力量,对于我国人才总体水平提升具有非常重要的价值。建设一支业务精湛、充满活力、师德高尚、结构合理的教师队伍,是有效促进我国高等教育内涵
方向图综合技术被广泛应用于雷达、声呐等领域,是大型天线阵列设计的关键问题。在雷达应用中,大型天线阵列通过方向图综合技术实现对空间中某些角度区域的增强,对其他区域的
球磨机是水泥生产行业的物料粉碎设备,由于缺乏可靠的磨机负荷检测手段,使得球磨机长期处于高功耗、低效率的工作状态下。并且球磨机在工作时,无法在其内部安装负荷测量装置,
未来移动网络数据传输量将呈现爆炸式增长,而地面通信资源紧缺,急需向空间拓展新的通信维度,否则将造成通信性能瓶颈等问题。为了解决该问题,可以利用移动性高和具有视距传输
片上网络(Network-on-Chip,NoC)作为一种新的通讯架构,相对于传统总线具有并行度高、扩展性强等特点。片上网络启用流量拆分带来了多路径路由功能,显著地增加了链路带宽。然而,
不平衡数据分类问题在数据挖掘领域占有重要的地位,如何有效处理不平衡数据已然成为当前的一个研究热点。采用传统的分类模型时,数据的失衡往往造成分类面的偏倚,导致难以得到令人满意的分类效果。现今,国内外学者相继提出了多种用于解决类不平衡问题的方法,但并没有充分考虑到数据的分布对分类模型性能的影响。针对传统模型出现的偏倚问题,本文基于代价敏感学习的思想,充分讨论了数据分布特性对分类器性能的影响。同时,本文
进化计算(Evolutionary Algorithms,EAs)是一种随机搜索范畴的优化算法,可以用来解决多个目标且相互冲突的多目标问题。在现实世界中有许多这样的实际问题,如工业调度,控制设计等。然而,这些问题可能随时间发生变化。这对EAs是一个挑战性的问题。因此,EAs是一个重要的研究课题。有多个目标互相冲突并且它们随着时间发生变化,这类问题叫动态多目标优化问题(dynamic multi-o
技术侦查措施在司法实践中已经应用广泛,并且借助科技优势和运行方式的不易被察觉特点,成为刑事侦查的重要手段,但是《刑事诉讼法》中关于技术侦查的规定适用范围、对象、程
无人水面船在自主执行任务时需要对周围的环境进行实时感知,通过检测前方视野范围内是否存在障碍物来进行避障,视觉传感器具有成本低、分辨率高等优点,因此,本文采用视觉传感器获取无人船周围的动态环境信息,并基于图像处理技术对水面目标进行检测,水面目标检测技术的研究对无人船的自主导航具有十分重要的现实意义。针对水面目标检测正确率低、实时性差的问题,本文设计基于水天分界线的目标检测方法。方法主要研究了三部分内
作为5G的候选技术,非正交多址(Non-Orthogonal Multiple Access,NOMA)和多输入多输出(Multiple-Input Multiple-Output,MIMO)分别实现了信号在功率域和空间域的复用,有效地提