在生物体内,蛋白质是组成生命结构并且进行生命活动最主要的功能分子。它是决定生物体结构和功能的重要成分。蛋白质的结构决定蛋白质的功能,所以了解和掌握蛋白质功能的前提是先分析蛋白质的结构。如何预测蛋白质结构是一个非常重要的研究课题,而获取蛋白质空间结构的一个重要途径就是理论预测。蛋白质的二级结构作为其空间结构的基础,研究蛋白质二级结构是了解蛋白质的折叠模式和三级结构的理论基础,并为研究蛋白质的功能以及它们之间的相互作用模式提供结构基础,同时还可以为新药研发提供帮助。所以我们非常有必要对蛋白质的二级结构的预测进行研究。本文选取序列同源性低于30%的62和100个蛋白作为两个数据集,通过提取几种原子化学位移信息作为新的特征参量,然后应用二次判别法对其蛋白质二级结构进行预测,进行交叉检验取得了较好的结果,三态预测的总精度达到80%以上。可见,选取化学位移作为特征参量和用二次判别法进行预测的结合可以有效的对两个数据集中的蛋白质二级结构进行预测。同时,通过联合不同的原子化学位移作为特征实施预测,结果表明：在蛋白质二级结构预测中,6种原子化学位移所起的作用是不同的。