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锈赤扁谷盗Cryptolestes ferrugineus和土耳其扁谷盗Cryptolestes turcicus属鞘翅目Coleoptera扁谷盗科Laemophloeidae,是一类全球性分布第二食性储粮害虫,以在粉类和破碎的粮食、谷物中发生最多。目前,对于两种扁谷盗研究主要集中于形态学、生态学和生物学特性等方面,分子研究数据较少,只有COI基因用于系统发育分析。因此,对扁谷盗线粒体基因组的测序可以丰富现有的线粒体全基因组数据,为进一步进行比较基因组学研宄提供基础数据。本文通过长片段PCR(Long-PCR)技术对绣赤扁谷盗及土耳其扁谷盗线粒体基因组序列进行了扩增和测序,得到全长并分析其特征。同时基于绣赤扁谷盗及土耳其扁谷盗在内的24种农业昆虫线粒体基因组数据,利用不同方法(最大似然法、邻接法和贝叶斯法)构建了系统发育树,分析它们的系统发育关系。主要结论如下:1.锈赤扁谷盗和土耳其扁谷盗线粒体基因组长度分别为15,511bp和15,517bp,注释得到13个蛋白质编码基因(PCGs)、16Sr RNA和12Sr RNA基因、22个t RNA基因和AT富集区序列。两种扁谷盗的线粒体基因组序列具有较高的A+T含量,分别为76.4%和76.9%。2.锈赤扁谷盗及土耳其扁谷盗线粒体蛋白质编码基因均以ATN起始编码,而终止密码子具有多样性,有完整的终止子TAA、TAG及不完整的TA或单个碱基T。3.两种扁谷盗22个t RNA长度在60-71 bp之间,AT含量分别约为76.2%和77.2%。在这22个t RNA基因中,除t RNASer基因二氢尿嘧啶臂(DHU stem)结构有缺失外,其他21个均可折叠成三叶草二级结构。这些t RNA二级结构中普遍存在碱基错配,锈赤扁谷盗和土耳其扁谷盗线粒体t RNA二级结构分别存在28处和21处。4.锈赤扁谷盗及土耳其扁谷盗线粒体AT富集区分别为859bp及857 bp,AT含量高达86.5%和86.0%。在两种扁谷盗线粒体AT富集区中存在不同数量的Poly-T、Poly-A结构以及(TA)n、(AT)n等微卫星结构。5.利用线粒体基因组13个蛋白质编码基因(PCGs)及2个核糖体RNA,分别使用NJ、ML和BI法构建鞘翅目24种常见农业昆虫的系统发育树,3种系统发育树均支持扁谷盗科为单系,属于扁甲总科,与扁甲科具有较近的亲缘关系。