离子结构解析与串联质谱分析都离不开解离技术,在涉及物质结构分析的蛋白质组学以及生物化学等领域中,通过阱内离子解离技术得到的碎片离子信息推断前体离子结构具有重要的作用。近年来,随着生物化学分析对质谱提出的新需求,研究人员陆续开发了一系列阱内离子解离技术,但仍然有一些问题亟待解决:(1)低质量截止效应(LMCO);(2)碎片种类不够丰富;(3)解离效率有待提高。针对以上问题,开发了一台四极杆-线性离子阱质谱,在质量分析器原理的基础上进行了整机的设计,重点进行了前后预四极-四极杆质量分析器的仿真和机械设计,在搭建完整个仪器平台后,对整机性能指标进行测试,仪器的质量扫描范围为0-2000 amu,分辨率达到单位分辨,线性回归方程中的相关系数R~2=0.9995。为了提高解离效率,利用平台四极杆和离子阱轴向组合的特点,针对仪器参数对新型离子解离技术进行仿真,通过对解离前和解离时两个状态下母离子运动轨迹的仿真,验证解离技术的可行性,最后针对四极杆-线性离子阱平台,设计了新型碰撞诱导解离技术的实验。通过射频电压和腔内气体压力等质谱参数对不同样品解离效率的影响,总结出新型碰撞诱导解离技术的规律及特点,并与常规碰撞诱导解离效率进行比较,得到较好结果。最后将新型碰撞诱导解离技术与常规碰撞诱导解离技术结合,扩展仪器功能并应用于临床样品检测。