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烟草西柏三烯二醇（CBT-diols）不仅是烟叶中香气成分的重要前体物质,还具有抗癌、抗菌等药用价值,为筛选CBT-diols含量性状优异种质、提高优异资源的利用率,本研究首先利用10个烤烟品种配制不完全双列杂交,利用超高效液相色谱（UPLC）测定亲本和组合中CBT-diols含量,并对其进行遗传效应分析;其次以筛选的高CBT-diols含量种质织金黑吊把和低CBT-diols含量种质Mont Clame Brun为亲本配制杂交组合,获得P1、P2、F1、F2的四世代遗传分析群体,测定F2群体单株CBT-diols含量,利用“主基因+多基因”混合遗传模型对CBT-diols含量相关基因进行遗传分析,分析其遗传模型,并利用SSR分子标记对CBT-diols含量进行QTL定位,获得烟叶中CBT-diols含量相关的QTL。最后,对222份烟草种质在两年两点环境下CBT-diols含量进行检测,筛选出在不同环境条件下表现稳定的高、低CBT-diols含量优异种质;并利用SSR分子标记对烟叶中CBT-diols含量进行关联分析,获得与CBT-diols含量相关联的分子标记,研究结果如下:1.不完全双列杂交结果表明,CBT-diols含量同时受到加性效应和显性效应的影响,但所占比例不同。中烟102具有显著正向加性效应,翠碧1号和中烟86具有显著负向加性效应,大白筋599×红花大金元呈极显著正向显性效应,G80×金星6007和NC89×金星6007呈显著负向显性效应。α-CBT-diol、β-CBT-diol及总CBT-diols的狭义遗传力分别为0.4029、0.3889、0.3994,并且均达到显著水平。另外,α-CBT-diol、β-CBT-diol与总CBT-diols 3个性状两两之间均达到极显著正向相关,且加性效应、显性效应、基因型和表型相关系数均达到0.98以上。2.对织金黑吊把×Mont Clame Brun杂交四世代群体CBT-diols含量测定后进行遗传分析,结果表明:组合的α-CBT-diol、β-CBT-diol与总CBT-diols 3个性状均受2对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因（E-0）控制,2对主基因的加性效应均为正值,显性效应值均为负值,且第1对主基因的加性效应及显性效应均高于第2对。CBT-diols含量3个性状的主基因遗传率分别为76.96%、76.88%、77.55%,多基因遗传率不到1%。因此,CBT-diols含量主要受遗传效应的影响,并以主基因遗传为主。3.利用68个SSR标记构建了与CBT-diols含量相关的遗传图谱,该图谱由16个连锁群组成,总长度为703.4 cM,每个连锁群标记数量为2～9个,标记间遗传距离在1.1～36.2 cM之间,平均距离为10.34 cM;利用完备区间作图（ICIM）对CBT-diols含量进行QTL定位,α-CBT-diol、β-CBT-diol与总CBT-diols 3个性状分别检测到4个QTL,并且每个性状的4个QTL都与其他性状的QTL在同一位置,分别位于LG2、LG8a、LG23a和LG24,共可解释CBT-diols含量性状14.3499%～14.42%的表型变异。4.对222份烟草种质在两年两地种植后的CBT-diols含量进行检测,结果表明四川西昌的烟草种质CBT-diols含量总体大于山东诸城种质CBT-diols含量,在2个及以上环境中CBT-diols含量均较高的种质有CV87、CV58、抗88、CT709、达磨、NC82和云烟2号,含量均较低的种质有SPG-172、I-35、中烟14、K730、晋太49、TI1112和RG3414。5.利用4个环境下烟叶中CBT-diols含量与SSR分子标记进行关联,共检测到37个SSR标记至少在一个环境中与烟叶中CBT-diols含量显著关联,表型解释率分布在1.87%～22.17%之间,分布在14个连锁群上。