【摘 要】
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目的：采用计算机辅助药物设计的方法研究基质金属蛋白酶及其小分子化合物抑制剂间相互作用关系。 方法：本论文采用Gausssian98中的ONIOM方法来研究[TpZnOH]与催化锌离子结合
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目的：采用计算机辅助药物设计的方法研究基质金属蛋白酶及其小分子化合物抑制剂间相互作用关系。
方法：本论文采用Gausssian98中的ONIOM方法来研究[Tp
ZnOH]与催化锌离子结合集团的相互作用。体系的总能量：E(ONIOM2)=E(high，model)+E(low,real)-E(low,model)=E(high，model)+AE(low,real←model)E(high，model)采用B3LYP方法，机组是6-31+G来优化，6-311g机组计算能量；E(low，real；)及E(Low，model)采用半经验算法AM1来优化和能量计算。
结果：利用ONIOM(B3LYP/6-311G(d，p)| AM1/6-31G(d，p))方法优化，OH<->配体，形成四配位的配合物的结构。其中Zn-OH键长是1.831A，与晶体数据1.847A非常接近，证明[TpZnOH]几何结构优化合理。
本文对可能的ZBG配合物进行了详细的计算，其中包括四配位的卤素配合物(F<->酉己体、Cl<->配体、Br<->配体、I<->配体)及SH<->配体；单氧配合物CF<,3>CO<,2><->配体、C<,7>H<,6>SNO<->配体、CF<,3>CH<,2>O<->配体；单氮配合物C<,4>H<,6>N<,2><->配体和C<,5>H<,5>N<,6><->配体；单硫配合物CH<,3>CH<,2>S<->配体；单碳配位配合物NCCH<,2><->配体；五配位的配合物C<,4>H<,4>ON<,3><->配体、C<,2>H<,3>O<,3><->配体、C<,6>H<,5>O<,2>S<->配体、HOCH<,2>CH<,2>CO<,2><->配体、C<,2>H<,4>NO<,2><->配体；介于四配位和五配位之间的配合物NO<,3><->配体，得到了优化的Zn-ZBG键长。将优化的Zn-ZBG键长与晶体数据相比较，并结合Zn-ZBG的热力学数据分析表明，其中F<->、C<,5>H<,5>N<,6><->、NO<,3><->和C<,2>H<,4>NO<,2><->活性较高。
结论：本文从合理的模型出发，使用ONIOM(B3LYP/6-311G(d，p)| AM1/6-31G(d，p)方法模拟基质金属蛋白酶与抑制剂的相互作用，计算结果来看比较成功，可以与实验结果进行比较，为进一步的理论和实验研究提供参考。
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