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辣椒（Capsicum annuum L.）,茄科辣椒属,为一年或有限多年生草本植物。辣椒营养丰富,维生素C含量在蔬菜中居第一位。作为不可或缺的调味品,在我国普遍种植。但辣椒栽培生产中连作障碍现象严重,嫁接作为有效克服连作重茬,缓解辣椒病害的手段,在栽培中广泛应用。而砧穗亲和性是嫁接成功和嫁接苗后期正常发育的关键。本研究通过对八十种辣椒嫁接组合的亲和性进行评定,将嫁接组合分成亲和性高组合、亲和性中等组合和亲和性低组合三大类。在每类嫁接组合选出两种嫁接组合,共六组作为试验材料,研究辣椒不同亲和性的嫁接组合的形态指标,光合特性,内源激素,根系特性,嫁接面组织学以及遗传基因亲缘性,探究辣椒嫁接亲和性的机理。主要结果如下:1.辣椒砧木接穗之间不同的亲和性对嫁接苗后期的形态发育有影响,相比于亲和性良好的砧穗组合,亲和性不良的嫁接苗容易发生生长停滞或接穗徒长。2.辣椒在嫁接之后光合速率,光化学活性等光合特性都会有所提高,但对于亲和性良好的砧穗组合BQ/LI,YLM/4光合作用的提高更为明显,亲和性表现不佳的组合ZB/2,TAN/LI光合作用的提升不明显,而且受胁迫情况更为严重。3.嫁接苗的内源激素IAA,CTK,GA3与嫁接亲和性呈正相关,ABA负相关。IAA主要对愈伤组织的生成和维管束的连接起促进作用。CTK和GA3在愈伤组织的增殖分化和信息交流的过程起着作用。ABA可能与导管分子的分化有关。4.从相对电导率的变化趋势看,嫁接亲和性低的组合ZB/2,TAN/LI的叶片细胞在愈伤组织分化和维管束连接时受到的胁迫严重,根系活力相对较弱,矿质元素和水分的输送能力较弱。5.根据对石蜡切片结果的观测,亲和性良好的砧穗BQ/LI,YLM/4嫁接面在愈合期隔离层容易消失,愈伤组织的交流顺畅。而亲和性不佳的组合ZB/2,TAN/LI会形成厚厚的隔离层,并且隔离层不会消失,阻碍砧穗进行交流。6.对辣椒品种的亲缘性进行测定,对嫁接砧穗的亲和性进行对比。发现砧木接穗之间遗传距离远近与嫁接亲和性高低呈现负相关,树状图的聚类分析看出,亲和性高的嫁接组合,接穗与砧木的遗传关系相对较近,而低亲和性的砧穗组合遗传关系相对较远。