研究生发表论文制度是目前国内各高校普遍采用的研究生培养质量保障措施之一。同时研究生发表的学术论文又被用来衡量研究生的科研能力和水平。新疆农业大学自2005年以来，要求研究生在获得学位前必须在公开的期刊（即在CNKI上可查询到，并且有相应的期刊号码）上发表一定数量与学位论文相关的学术论文。其目的是促进研究生科研水平的提高，增强研究生的学术能力，同时提高学校的综合科研能力。此制度实施以来既有其合理性，同时又暴露出一些弊端，为了能够深入了解该制度对学校研究生培养质量的影响，本文从以下几个方面进行研究：首先对国内外研究生发表论文制度的现状进行综述；其次统计分析了2005－2011年为学校获得硕士学位研究生的发表论文情况，通过统计发现研究生发表论文制度实施七年以来，大幅度促进了学校硕士研究生发表高水平的学术论文，对优秀学位论文和研究生培养质量等方面有积极的影响；第三，引入虚拟变量(Dummy Variables)分别讨论该制度实施前后对硕士研究生发表学术论文数量的影响情况，该制度实施前三年研究生发表的第一作者论文总数还不到一百篇，实施以后发表的第一作者论文数量每年均超过了一百篇。同时分析了发表论文的相关特征：研究生发表论文制度实施积极效果明显、研究生已成为学校科研力量的主力军、跨学科相互合作成为提高科研的主要趋势等。第四，通过问卷的形式对研究生、导师、专家等人员进行调查，分析这一制度实施过程中存在的问题：有限的资源与大量的需求之间的矛盾、发表论文所在刊物整体分散与部分集中的矛盾、研究生发表论文数量与质量的矛盾、高档次与低水平重复性论文之间的矛盾、不同学科之间发表论文数量和质量的矛盾。第五，提出解决问题的三条建议和对策，供管理部门下一步决策时参考，即：按研究生的类型实施研究生发表论文制度、按自然科学和人文社会科学分类实施研究生发表论文制度、实施多元化的研究生发表论文制度。