MicroRNA在HPV16(+)宫颈鳞癌组织中的异常表达及其临床意义

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:geng20516136
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:   利用MicroRNA基因芯片技术,筛查HPV16(+)宫颈鳞癌组织中异常表达的miRNA基因谱,选取兴趣基因,进行分析,初步探讨基因异常表达的临床意义   材料与方法:   一、材料   实验组3例:选择收集2009年9月到2010年10月中国医科大学附属盛京医院妇产科确诊为宫颈鳞癌Ib期(HPV16+)并行手术治疗的患者共3例,手术方式为经腹广泛性全子宫切除术+盆腔淋巴结清扫。对照组3例:选取实验组患者宫颈正常切缘组织。   二、主要试剂   主要试剂及仪器:Trizol试剂(R)试剂盒(Invitrogen生命技术),miRCURYTMArray Power标记试剂盒(Cat#208032-A,Exiqon),miRCURYTM Array洗涤液试剂盒(Cat#208021,Exiqon),miRCURYTM芯片(Exiqon),移液器及吸头,分光光度仪,GenePix4000B芯片扫描仪   三、方法   基因芯片技术   将约50-100mg新鲜样本组织块放入1.5ml Eppendorf管中液氮保存,从液氮中取出Eppendorf管,使用BioPluverizerTM冰冻粉碎组织,加入1ml Trizol(Invitrogen)混匀后,使用MiniBead-Beater-16匀浆后提取RNA。使用Nanodrop测定RNA在分光光度计260nm、280 nm、230 nm的吸收值,以计算浓度并评估纯度。用甲醛电泳试剂进行变性琼脂糖凝胶电泳,检测RNA纯度及完整性。用标记酶将Hy3TM或Hy5TM荧光集团标记合格的RNA(miRCURYTM Array Power标记试剂盒,Exiqon公司),具体芯片杂交标记及杂交由上海康成生物公司完成。   四、统计学分析   利用GenePix4000B芯片扫描仪扫描芯片的荧光强度,并将实验结果转换成数字型数据,通过T-test筛选出的差异表达miRNA(p≤0.05)并根据这些miRNA的分层聚类。利用Scatter Plot等软件对数据进行分析,得出具有统计学意义的差异表达基因,筛选兴趣基因,通过(MICROCOSM,TARGETSCAN,PICTAR-VERT)预测差异miRNA的靶基因,进行GO、pathway分析。   结果:   1、72个miRNA的表达差异具有统计学意义,其中68个表达上调,4个表达下调   2.选取miR-155,miR-218,miR-21,miR-24,miR-214为兴趣基因,进行后续GO、pathway分析。   结论:   利用基因芯片,筛查HPV16(+)宫颈鳞癌组织中异常表达的microRNA,我们预测异常表达的72个microRNA与HPV16导致的宫颈癌的发生、发展、转移等密切相关,其异常表达在疾病发展中起重要角色,对疾病的诊治及预后起关键作用。
其他文献
目的:   研究降脂中药血脂康对辽宁阜新县农村高血压患者的辅助降压作用以及其调脂作用。   方法:   我们采取整体、随机、盲法的设计方法,对入选的2683名辽宁阜新县
目的:   通过观察剖宫产瘢痕妊娠不同分型的临床及病理学特点,探讨其临床诊断手段,并为进一步解释其发病机制提供理论支持。   方法:   收集2005年1月至2010年5月于中
目的:骨密度和体成分是复杂性状,内在互为联系。近期研究发现甲基转移酶-21C(methyltransferase-like 21C,METTL21C),又名C13orf39,位于13q33.1,有264个氨基酸,是7β链甲基转