重症肌无力的多基因多位点单核苷酸多态性分析

来源 :天津医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:guoyuan22
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背景:重症肌无力(myasthenia gravis,MG)是T细胞依赖的慢性自身免疫性疾病,由神经肌肉接头处乙酰胆碱受体抗体介导,以骨骼肌、延髓肌和眼外肌波动性的疲乏无力为特点,其病因尚未完全明确。国内外关于重症肌无力的遗传流行病学研究表明,其发病与遗传、内分泌、环境和免疫等因素有关,但是任何一种因素都不能完全解释MG的发病机理。有学者认为多因素、多基因积累共同导致了MG的发生,不同的个体可能存在不同的病因组合,其中遗传基因的易感性占了重要地位。大量研究表明,不同的自身免疫性疾病可能有共同的易感因素,一种自身免疫性疾病的易感基因可能会与其它自身免疫性疾病相关。单核苷酸多态性(SNP)是人类基因组中最常见的遗传多态性,常用来研究与复杂性疾病的关联性。而且,在不同的人种SNP与疾病易感性的相关性可有不同结果。本研究筛选了与日本其它自身免疫性疾病如类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等易感性紧密相关的9个异常SNP作为研究重点,试图研究这些基因多态性与MG的相关性。目的:分析分化群244(CD244)rs6682654、Fc受体样因子3(FCRL3)rs7528684、可溶性载体家族22A4(SLC22A4)rs2073838、Runt相关转移因子(RUNX1)rs2268277、信号传导及转录激活因子4(STAT4)rs7574865、肿瘤坏死因子受体相关因子1(TRAF1)rs3761847、补体成分5(C5)rs10818488、B淋巴细胞激酶(BLK)rs13277113、干扰素调节因子5(IRF5)rs2004640的单核苷酸多态性,研究日本重症肌无力与这些异常基因和位点的相关性,探讨MG的遗传背景及发病机制,以便早期基因诊断和早期筛选MG高危人群,为MG的治疗提供依据。方法:采用病例-对照研究的方法,病例组纳入日本东京女子医科大学门诊和病房的52例重症肌无力患者,抽取外周血抗凝,提取白细胞DNA,利用ABI stepone实时定量PCR仪和taqman SNP genotyping试剂盒荧光探针技术,检测这些单核苷酸多态性位点,以既往对日本人进行研究的文献中以上位点的正常对照为对照,进行Hardy-Weinberg平衡分析,计算OR和95%可信区间(CI),行卡方检验统计分析这些SNP与MG的相关性。结果:1.IRF5 rs2004640的T等位基因和TT基因型与日本重症肌无力易感性相关(T vsG:χ2=12.552, P<0.001, OR=2.071, 95%CI[1.375-3.118]; TT vs TG+GG;χ2=15.641,P<0.001,OR=3.719,95%CI[1.868-7.400]),提示该SNP是MG的风险因素。2.FCRL3 rs7528684的C等位基因和CC基因型与MG易感性无相关(C vs T:χ2=0.508, P=0.476, OR=0.861, 95%CI[0.570-1.300]; CCvsCT+TT:χ2=0.506,p=0.479,OR=1.306,95%CI[0.622-2.743]),提示该SNP不是MG的风险因素。3.CD244 rs6682654的T等位基因和TT基因型与MG易感性无相关(T vs C:χ2=0.225, P=0.635, OR=0.908, 95%CI[0.608-1.356]; TT vs CT+CC:χ2=0.402,P=0.526,OR=0.771,95%CI[0.344-1.728]),提示该SNP不是MG的风险因素。4.SLC22A4 rs2073838的A等位基因和AA基因型与MG易感性无相关(A vs G:χ2=0.177, P=0.674, OR=1.093, 95%CI[0.723-1.652]; AA vs AG+GG:χ2=2.027,P=0.155,OR=1.740,95%CI[0.804-3.764]),提示该SNP不是MG的风险因素。5.RUNX1 rs2268277的C等位基因和CC基因型与MG易感性无相关(C vs G:χ2=0.088, P=0.7671 OR=1.064, 95%CI[0.706-1.605]; CC vs CG+GG:χ2=1.769,P=0.183,OR=0.499,95%CI[0.176-1.417]),提示该SNP不是MG的风险因素。6.STAT4 rs7574865的T等位基因和TT基因型与MG易感性无相关(T vs G:χ2=0.048, P=0.826, OR=1.048, 95%CI[0.692-1.586]; TT vs TG+GG:χ2=0.366,P=0.545,OR=0.729,95%CI[0.260-2.040]),提示该SNP不是MG的风险因素。7.TRAF1 rs3761847的A等位基因和AA基因型与MG易感性无相关(Avs G:χ2=0.158, P=0.691, OR=1.082, 95%CI[0.734-1.595]; AA vs AG+GG:χ2=0.054,P=0.816,OR=0.921,95%CI[0.459-1.846]),提示该SNP不是MG的风险因素。8.C5 rs10818488.的G等位基因和GG基因型与MG易感性无明显相关(G vs A:χ2=0.592, P=0.442, OR=1.164, 95%CI[0.790-1.716]; GG vs AG+AA:χ2=0.071,P=0.790,OR=1.095,95%CI[0.560-2.145]),提示该SNP不是MG的风险因素。9.BLK rsl3277113的G等位基因和GG基因型与MG易感性无相关(G vs A:χ2=0.649, P=0.421, OR=1.182, 95%CI[0.786-1.777]; GG vs AG+AA:χ2=0.345,P=-0.557,OR=1.276,95%CI[0.564-2.886]),提示该SNP不是MG的风险因素。结论:ABI stepone实时定量PCR仪和stepone software 2.1具有自动单核苷酸多态性基因分型识别功能,具有直观的图表输出和量值分配特性,可准确快捷获得基因分型结果。本文首次分析了FCRL3 rs7528684, CD244 rs6682654, SLC22A4 rs2073838. RUNX1 rs2268277. STAT4 rs7574865. TRAF1 rs3761847、C5 rs10818488、BLK rs13277113和IRF5 rs2004640的单核苷酸多态性与日本重症肌无力的相关性,发现IRF5 rs2004640与MG易感性相关,显示了该SNP在自身免疫性疾病中的作用。但是其余8个SNP均未发现与日本重症肌无力易感性相关。此外由于种族差异,仍需进行大样本量、不同种族的重复性研究。
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