海洋细菌SAR86全球分布及其多样性研究

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地球表面积约有71%是海洋,海洋环境独特且复杂,其中海洋微生物多样的生活环境与种类是海洋生态系统的重要组成部分。海洋微生物在高压力、高盐度、低温度、寡营养状态等特殊环境中具有可适应的生理特征和独特的细胞结构,由于适应这些特殊环境的独有机制,成为了生命起源演化与微生物进化的基础。浮游细菌是海洋微生物的重要组成部分,在“微生物食物环”中发挥非常重要的作用,它的生产力相当于整个海洋初级生产力的10-80%左右,这种过程还承担着海洋中75-95%有机质的分解任务。海洋环境中的变形菌门作为重要的浮游细菌类群,它们在海洋中的碳循环和氮循环等物质循环中都具有很重要的作用。在海洋中,变形菌门是主要的微生物类群之一,隶属变形菌门γ-变形菌纲的海洋细菌SAR86近年来成为研究热点之一。本研究采用生物统计学、分子生态学以及高通量测序分析等方法对海洋细菌SAR86的全球分布及其生态功能进行研究分析。我们对NCBI数据库里的3398条SAR86序列进行分析,这些序列采集自五大洋中的海水样品。基于对扩增的16S rRNA序列分析,发现SAR86的多样性在分类学水平上显示出明显的生物地理学分布特征。通过数据分析,我们发现在秋季和冬季的SAR86通常在海洋细菌群落中占主导地位,同时SAR86一般分布在距海水表层100米以上,而秋冬季大多数分布在50米左右。另外发现该细菌大多分布在大西洋与太平洋。同时在寡营养水域中丰度较高,可能对海洋中碳的生物地球化学循环很重要。经过功能预测宏基因组分析结果表明,SAR86可以参与如氨基酸代谢等18种相关的代谢。同时,功能与分类学组成有着很大相关性。对海洋细菌SAR86的全球分布研究使我们对该细菌类群多样性及功能性更加深入的了解。
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