建立自然保护区是保护生物多样性的重要手段，在遏制生物多样性丧失和维持生态系统服务功能方面具有不可替代的作用。本研究以海南岛为研究区，在遥感和GIS技术支持下，基于1988年、1998年和2008年3期遥感影像，从天然林维护和土壤保持功能的保护现状、变化趋势以及影响因素三个方面评估了海南岛自然保护区体系及单个保护区对天然林和土壤保持功能的保护与管理效果。研究结果表明:　　(1)从1988至2008年，保护区内部天然林丧失率远低于保护区外，保护区内部天然林覆盖率减少了2.3个百分点，但区外0-5km、5-10km分别减少了11.3和9.4个百分点。另外，保护区内部破碎化程度显著低于外围(P＜0.05)，表明保护区对天然林的丧失与破碎化有明显的抑制作用。　　(2)保护区内部平均单位面积土壤保持量是1951.59 t·hm-2·a-1，分别是区外0-5km、5-10km和全省平均水平的2.4倍、3.2倍和2.9倍，另外，尽管20年间保护区内外土壤保持功能呈现不同程度的退化趋势，但保护区内显著低于区外（P＜0.05），保护区在土壤保持功能的保育方面也发挥着重要作用。　　(3)但20年间，60％的保护区内部天然林面积有所减少，50％的保护区土壤保持量有所下降。且与前10年相比，后10年天然林丧失与土壤保持功能退化程度进一步恶化，自然保护区的保护效果有待进一步提高。　　(4)橡胶林和浆纸林的扩张化，保护区本身状况及周边社会经济水平发展是影响海南省自然保护区保护效果的主因。建议加强保护区的管理对策，完善天然林保护政策，提高保护区管理水平，加强保护区对天然林及土壤保持功能的动态监测与评估，建议将土壤保持等关键生态系统服务的重要区域纳入自然保护区体系规划。