微藻多糖是微藻中最重要的生理活性物质之一,已成为肿瘤治疗中新的药物资源。本研究分析了小球藻（Chlorella sp.）胞外多糖（CEPS）和杜氏盐藻（Dunaliella salina）胞外多糖（DsEPS）对宫颈癌细胞（Hela）的毒性及生长的抑制作用,并利用转录组分析揭示其抗肿瘤活性作用机制。结果表明,CEPS和DsEPS均可抑制Hela细胞增殖,降低细胞活力,当浓度为1.0 mg/mL时,两者对Hela细胞的抑制率均高于IC₅₀,而对正常Vero细胞没有毒副作用。凋亡率分析得出,Hela细胞自发凋亡率是5.42%;当CEPS和DsEPS浓度为1.0mg/mL时,作用不同时间（24 h,48 h,72 h）,CEPS对应的凋亡率分别为37.34%、42.26%、45.1%,DsEPS对应的凋亡率分别为39.78%、40.15%、43.56%。转录组分析结果显示,对照组和CEPS组之间存在1894个差异表达基因（DEGs）,其中1076个上调,818个下调;对照组和DsEPS组之间存在2032个差异表达基因,其中1132个上调,900个下调。GO功能注释分析显示,CEPS组产生了63个的GO二级分类,DsEPS组产生了62个的GO二级分类,其中细胞过程、单一生物过程和生物调节这三个是生物过程的主要类型,结合是分子功能的主要类型;同时许多DEGs被富集到生物黏附、生殖过程、信号等条目上,证实差异表达基因的功能与细胞增殖、信号传导、细胞粘附等重要功能密切联系。KEGG富集分析结果表明,CEPS组与对照组共有43条代谢途径表达差异显著（p<0.05）,DsEPS组与对照组共有38条代谢途径表达差异显著;许多与肿瘤相关的信号转导途径被显著富集,包括TNF信号途径、MAPK信号途径、VEGF信号途径、Ras信号途径、cAMP信号途径和PI3K-Akt信号途径等。通过DEGs构建蛋白互作网络,CEPS的PPI网络由279个节点组成,其中有13个hub基因;而DsEPS组的PPI网络由161个节点组成,计算出有10个hub基因;并且发现CEPS组和DsEPS组共有的hub基因形成的一个的局部网络,包括的中枢基因有PTPN11、RSAD2、ISG15、IFIT1、MX2、IFIT2、OASL、OAS1、JUN、OAS2、XAF1、ISG20和IRF9,其中大多数hub基因与癌症的发生有关。为了验证转录组测序结果,从不同的信号通路中选择13个DEGs进行实时荧光定量PCR（qPCR）,qPCR结果与转录组测序基因差异表达趋势一致,表明转录组测序结果真实有效。本研究表明,CEPS和DsEPS可以做为癌症后续介入治疗的潜在药物分子。