龟鳖目的化石最早出现在约2亿年前。全世界现生龟鳖种类仅存15科96属317～331种。我国现生龟鳖种类有6科22属36种。形态学研究是龟鳖分类学的基础，在分子系统学兴起之前也是龟鳖系统学研究的主要内容。到上一世纪中叶，随着染色体制备技术的发展，开始从染色体核型上探讨龟鳖的一些分类学和系统学问题。目前，关于龟鳖类的分类和系统学研究则主要集中在分子系统学方面。长期以来，龟鳖类的分类观点差异较大。龟鳖分类和系统关系方面至今还存在一些颇有争议的问题，如：闭壳龟属和盒龟属的分类存在较大争议。一些学者认为，闭壳龟属应该拆分为2个属。但另一些学者则认为不应该将闭壳龟属拆分为两个属。也有学者提议取消原盒龟属与锯缘龟属（Pyxidea）。因此，龟鳖类的分类问题还有待进一步研究。本研究对6科15属18种龟类作为研究对象，进行头骨解剖观察和分析，应用支序分类学方法对其系统发育和生态适应问题进行探讨，从形态性状上验证分子系统发育结果。解决闭壳龟属、盒龟属和锯缘龟属在分类和系统关系方面存在的问题。同时对陆龟科（Testudinidae）、泽龟科（Emydidae）、侧颈龟科（Pelomedusidae）、蛇颈龟科（Chelidae）和动胸龟科（Kinosternidae）的头骨进行科内及科间的比较分析。研究结果表明地龟科原盒龟属的黄缘闭壳龟与黄额闭壳龟头骨系统差异较小，而与地龟科闭壳龟属安布闭壳龟头骨系统差异较大，原锯缘龟属的锯缘闭壳龟与闭壳龟属安布闭壳龟头骨系统差异非常大，提示黄缘闭壳龟、黄额闭壳龟及锯缘闭壳龟不宜归入闭壳龟属。陆龟科龟类为了适应陆地生活，进化出了最大的眼窝。地龟科、泽龟科、动胸龟科龟类为了适应半水栖生活，眼窝比陆龟科龟类略小。侧颈龟科和蛇颈龟科龟类为了适应水栖生活，眼窝最小。动胸龟科龟类由于对食性的适应，进化出了发达的上颚骨。