论文部分内容阅读
本研究在鸡的第1、8、9、10、11、13条染色体上选取共计44个微卫星标记,结合固始鸡安卡鸡资源群体中记录的F2代个体的表型数据库,选取32个生长性状,10个肉质性状,16个屠宰指标,17个血清生化指标等共计75个表型数据,进行基因组扫描,对重要经济性状进行QTL定位。用cervus2.0软件统计群体各座位的等位基因组成,计算各微卫星位点分别在群体中的基因频率、杂合度、多态信息含量等指标。所有QTL通过QTL Express在线分析软件完成。QTL基因组1%和5%基因组显著水平的临界值通过1000次的全基因组重排法来确定。95%的QTL置信区间通过1000次有放回的随机抽样来确定。结果如下:(1)标记基因型进行分析结果显示,大部分标记的平均多态信息含量、平均杂合度均大于0.5,呈现高度或中度多态性,为该群体分子水平上的相关研究提供了可靠的依据;(2)在各条染色体不同位置上发现了影响0-12周龄生长性状、屠体性状、肉质性状、血清生化指标的QTL,在1号染色体上初步定位了27个QTL,分别包括16个生长性状、6个屠宰指标和3个血清生化指标;在8号染色体检测到23个QTL。包括16个生长性状、5个屠宰指标、1个肉质性状和1个血清生化指标;在9号染色体检测到7个QTL,包括4个生长性状和3个屠宰指标;在10号染色体上检测到18个QTL,包括10个生长性状、4个屠宰指标、2个肉质性状和2个血清生化指标;在11号染色体上检测到16个QTL,包括7个生长性状、7个屠宰指标和2个血清生化指标;在13号染色体上检测到11个QTL,包括6个生长性状、1个屠宰指标和4个肉质性状。个别QTL位点解释的表型变异超过10%,置信区间<30cM;多数QTL的置信区间均较大、所解释的表型变异较小,有待于进一步增加标记密度进行验证。另外,本研究定位的各个QTL在染色体上的位置与国内外已报道的位点有不同之处,可能是与目前QTL研究方法本身局限性有关,也可能存在一些未知的QTL,可能是首次发现。通过对鸡重要经济性状QTL定位分析,进一步认识鸡各数量性状的分子遗传基础,揭示其遗传的内在本质,有利于后续研究中通过比较基因组学和生物信息学克隆分析数量性状新功能基因,并进一步将标记运用于辅助选择育种策略,应用于鸡的育种实践。