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番茄种质资源是生物资源的重要组成部分,也是番茄育种工作的物质基础。本研究对新收集的266份番茄种质的35个表型性状指标进行了遗传多样性分析、相关性分析、主成分分析、聚类分析,确定了材料的遗传多样性丰富程度以及变异程度;在表型数据聚类分析的基础上,选择138个代表性种质材料,利用竞争性等位基因特异性PCR技术从374对SNP引物中筛选出核心标记,并进行种质的聚类分析;同时,针对前期组配的278份番茄杂交组合进行表型数据的调查,利用主成分分析、隶属函数分析,构建24个指标与每一主成之间的得分函数关系式,进行杂交组合综合评价。主要研究结果如下:1.表型性状研究结果表明,18个质量性状中有60个变异类型,遗传多样性指数在0.28～1.32之间,17个数量性状遗传多样性指数在1.14～2.02之间,表明收集的材料遗传多样性丰富、变异程度较大;相关性分析结果表明17个数量性状大多数存在显著或极显著的相互关系;主成分分析共提取七个主成分,累计贡献率达到70.95%;表型聚类结果将材料聚为八大类群,第一、二类群果实含糖量高、综合口感以酸为主,第三、四类群果实主要以圆形和高圆为主、单果质量较大,第五、六、七类群材料可溶性固形物含量较高、萼片形状以卷曲为主,果实商品特性方面具有较大优势,第八类群材料主要以无限生长为主,果实形状多数为圆形,果色以红色为主。2.筛选出多态性高的核心SNP标记106个,利用其进行SNP分型检测,共检测出324个等位基因,多态性信息含量平均为0.343,表现为中度多态性;遗传相似系数在0.155～1.055之间,平均值为0.667;基于SNP标记将138份材料聚为三大类群,分别包含41份、93份和4份材料;群体结构分析将供试材料划分为四个亚群。3.278份番茄杂交组合的F1代中17个果实性状指标的变异系数范围在13.44%～86.65%之间,可溶性固形物质量分数的变异系数相对较高,为31.59%,平均值6.79,综合口感评价以甜酸为主,果实外观形状主要以高圆和扁圆为主;植物学性状指标的变异系数范围为10.46%～55.11%。在主成分分析的基础上,利用隶属函数综合评价,筛选出综合表现最优的前 10个组合ZJ7269、ZJ7234、ZJ7142、ZJ7229、ZJ7151、ZJ7268、ZJ7144、ZJ7148、ZJ7112、ZJ7167。以上研究结果为今后番茄核心种质资源的收集、筛选和利用奠定了基础,为培育优良品质的番茄新品种提供了重要理论依据。