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非编码RNA在生命活动中起着非常重要的作用,如参与染色质结构的调节,转录和转录后加工的调控,蛋白质合成、转运和活性的调控等,但是已知的非编码RNA只占生物体内全部非编码RNA的很少一部分,绝大多数的非编码RNA还有待于被发现和进行功能研究。通过构建特殊的cDNA文库发现新的非编码RNA是一个比较有效的方法。本研究以鸡为模式生物,构建了富集小分子非编码RNA的文库,从中找到一大批新的非编码RNA,并利用Northern杂交实验验证了这些非编码RNA的存在。对这些新的非编码RNA进行的整体性的研究使我们对非编码RNA有了更深入的了解。首先,通过分析各种非编码RNA在鸡的不同组织和骨骼肌不同发育阶段中的表达,发现绝大多数非编码RNA在时空上具有不同的表达水平,说明这些非编码RNA在体内的产生和降解受到了严格的调控,提示它们在某些生命活动中具有重要的作用;同时发现鸡中许多的非编码RNA在小鼠和人类中并没有同源RNA分子的存在,基因组水平的比对也不能找到同源的序列,这说明生物体在进化中会产生相当多的物种特有的非编码RNA,这与蛋白质编码基因所具有的保守性相比具有显著的不同,这些非编码RNA可能在很大程度上决定了物种的独特性。本实验还发现了一个只在鸡的骨骼肌和心肌中表达的非编码RNA——MuN121,Blast分析表明它定位于一个已知的蛋白质编码基因的内含子之中,Northern杂交结果显示MuN121和该宿主基因在RNA水平具有一致的表达谱。为了研究MuN121的产生是经独立转录而来还是从pre-mRNA加工而来,我们构建了野生型和该内含子5’端剪接供体位点突变的2种载体,转染293T细胞发现突变体不能产生ncRNA而野生型能产生。表明MuN121的产生依赖于pre-mRNA的成功剪接,MuN121和宿主基因受相同的转录机制的调控。