为了满足农村地区广大人民群众的医疗服务保障的需求，提高农民群众的健康水平，我国自2002提出“建立以大病统筹为主的新型农村合作医疗制度”，并制定了相应的规则。经过反复的实践、探索和研究,在2003年开始进行个人缴费、集体扶持和政府资助相结合的合作医疗制度试点，2003年以来，在各级政府的领导下，各有关部门共同努力，广大农村居民积极参与，新农合工作取得了显著成效。农村地区已全面建立起新农合制度，制度框架和运行机制基本建立，农村居民医疗负担得到减轻，卫生服务利用率得到提高，因病致贫、因病返贫的状况得到缓解。2008年已全面覆盖农村地区，2009年第一季度参合人数已达到8.3亿，但是新型农村合作医疗制度实施过程中出现诸多问题，为了及时修正完善制度，使制度可持续发展，本文以肥城市为例，调查分析了新型农村合作医疗制度实施过程存在的问题，并提出了几点建议。　　本文主要采用调查问卷法、访谈法对山东省肥城市的新型农村合作医疗制度实施状况做了调查，调查对象包括：乡镇政府，乡镇医院与村卫生所、农民等。根据调查所得数据分为两方面进行分析。第一方面是新型合作医疗制度的制度设计方面存在的问题。主要从制度定位、筹资水平、报销比例、报销方式等方面进行分析；第二方面是配套设施方面存在的问题。该部分从基层医疗服务条件低下和政府责任不到位两方面入手，通过调查数据加以佐证。　　本文通过以上的调查分析，分别从制度设计、配套设施方面提出了未来完善新型合作医疗制度的建议，以期有利于提高农村医疗保障条件，满足农民群众医疗卫生需求，促进我国和谐社会的建设。