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小菇属Mycena(Pers.)Roussel作为伞菌中的重要类群,全世界至少有500种,多分布于北温带地区,绝大多数为腐生菌。小菇属真菌具有食用、药用价值或因含微量毒素及天麻栽培中作为萌发菌受到人们的关注。该属种类繁多,分类难度较大。19世纪后一直以Maas Geesteranus为代表的分类系统为主,进入20世纪后随着分子系统学研究的兴起,小菇属的分类发生新的转机,小菇属作为模式属成立小菇科的观点逐渐被认可。然而,由于分类尺度不同、取样量不足、认知水平不完善等诸多原因,导致小菇属内的系统学框架及与相关属之间的系统学关系研究处于模棱两可状态,一些物种的系统学位置如今仍存在争议。基于上述科学问题,本研究在广泛选取了中国各地小菇属材料的基础上,秉承多相分类的研究理念,对中国小菇属开展分类学及分子系统学研究。研究用的标本来自论文期间采集的452份和国内各大标本馆馆藏标本346份,通过对上述798份小菇属真菌标本的形态学观察,共鉴定出中国小菇属真菌56种,隶属于23个组,提供了分组及分种检索表,每个分类单元提供了详细的宏观形态和显微特征描述、野外生境照片及线条图。对文献报道的我国小菇属物种名称进行排查和整理,确认本研究未采集到的5个分类单元有分布,因错误鉴定及凭证标本丢失等原因,排除了8个分类单元在我国的分布,另11个物种名称有待进一步考证。分类学研究拟定新组1个:棘刺组sect.Amparoina T.Bau&Q.Na;发表及待发表新种12个:弯生小菇M.adnexa T.Bau&Q.Na,双囊小菇M.bicystidiata T.Bau&Q.Na,栗生小菇M.castaneicola T.Bau&Q.Na,樱桃红小菇M.ceracea T.Bau&Q.Na,粉霜小菇M.dealbata T.Bau&Q.Na,粉褶小菇M.entolomoides T.Bau,淡灰小菇M.griseotincta T.Bau&Q.Na,透柄小菇M.hyalinostipitata T.Bau&Q.Na稀褶小菇M.hygrophoroides T.Bau&Q.Na,芒生小菇M.miscanthi T.Bau&Q.Na,光柄菇状小菇M.pluteoides T.Bau&Q.Na和亚基盘小菇M.substylobates T.Bau&Q.Na;发现中国新记录种18个:阿尔及利亚小菇M.algeriensis Maire,碱味小菇M.amygdalina(Pers.)Singer,橙盖小菇M.aurantiidisca(Murrill)Murrill,黄缘小菇M.citrinomarginata Gillet,黄白小菇M.flavoalba(Fr.)Quél.,粉黄小菇M.floridula(Fr.)Quél.,绒柄小菇M.flos-nivium Kühner,异形刺小菇M.heteracantha(Singer)Desjardin,冬生小菇M.hiemalis(Osbeck)Quél.,离生小菇M.interrupta(Berk.)Sacc.,红斑小菇M.maculata P.Karst.,皮尔森小菇M.pearsoniana Dennis ex Singer,紫褐小菇M.purpureofusca(Peck)Sacc.,半被覆小菇M.semivestipes(Peck)A.H.Sm.,暗黑小菇M.silvae-nigrae Maas Geest.&Schw?bel,绣线菊小菇M.speirea(Fr.)Gillet,球果小菇M.strobilinoidea Peck和粉被小菇M.zephirus(Fr.)P.Kumm.。分子系统学研究选取8个相关属252条序列基于ITS构建系统发育树。采用贝叶斯分析法(Mrbayes)和最大似然法(RaxML)分析结果显示一致的拓扑结构,小菇科框架较为清晰,赤小菇属Cruentomycena、胶孔菌属Favolaschia、扇菇属Panellus、亮柄小菇属Resinomycena、黏柄小菇属Roridomyces、干脐菇属Xeromphalina形成单系群,并得到较好的支持,多数属与小菇属Mycena形成姊妹群,仅半小菇属Hemimycena属的界限并不明确。大尺度的系统发育分析显示了小菇属并非单系。首次基于ITS+nLSU+SSU多基因联合分析对小菇属进行了系统重建。结果表明,3个基因片段联合分析结果支持了单一片段得出的小菇属为多起源的结论,对属下2个主干分支具有较好的区分,即担孢子淀粉质与非淀粉质,划分为7个Clade。拟定的新组、新种均得到分子数据的支持。系统学结果与基于形态学结果提出的分类系统基本相吻合,个别形态学的组和种在系统树中轮廓不清晰,暗示了一些类群是多起源,并存在种内变异。