论文部分内容阅读
圆环病毒(Porcine circovirus PCV)在国内外养猪业存在普遍感染的情况,自发现以来圆环病毒的感染对世界各国养猪业都造成了巨大的经济损失。它可以侵袭猪体内的淋巴系统,使淋巴细胞有一定程度的减少,猪体免疫力下降,从而导致猪群无法健康成长。屠宰场是安全猪肉提供的重要场所,负责对生猪进行最后的处理,所以需要对其进行严格的病原检测,以防止病原进一步的传播。本研究主要采集2017年6月～2017年8月广西某市屠宰场181份淋巴结,进行PCV2与PCV3的病原检测,以此分析健康屠宰猪中圆环病毒携带情况。结果表明,在181份样品中,PCV2阳性份数是108,阳性率为59.67%;PCV3阳性份数是44,阳性率为24.31%;PCV2及PCV3混合感染份数是27,混合感染率为14.92%。这说明在健康屠宰猪群中圆环病毒的感染率较高,带毒情况较为严重。本研究成功获得5条PCV2全序列(1767bp),并根据序列分别对其进行了系统分析和构建遗传进化树。结果表明,5条PCV2全序列之间核苷酸同源性为96.1%-99.5%,5株ORF2的核苷酸同源性为94.0%-99.7%,5株氨基酸的同源性为94.0%-100.0%。通过与近年来广西境内的PCV2毒株及国内外PCV2毒株比较分析发现,广西主要流行PCV2b型,而其中PCV2b-1C亚群是优势毒株。本研究获得6条PCV3全序列(2000bp),并根据序列分别对其进行了系统分析和构建遗传进化树。结果表明,6株PCV3毒株全序列之间核苷酸同源性为98.6%～99.4%,ORF2基因之间的核苷酸同源性为97.2%-99.8%。而国内外现有的PCV3全基因的同源性为98.6%-99.9%,现有的PCV3 ORF2基因的同源性为97.2%-99.4%。说明目前世界各地的PCV3全基因序列同源性都较高,变异程度较低。通过遗传进化树来看,目前的PCV3毒株可以分为两大亚型,且这6条毒株在两个亚型中都有分布。此外还将PCVs的ORF2基因及其Cap蛋白进行了比较分析,结果发现PCV1、PCV2和PCV3亲缘性都比较远,虽然PCV1和PCV2都在同大一分支上,但是在分支中距离相差很远。PCV3在另外一个大分支上,且明显与其他两个型距离更远。PCV2 Cap蛋白与PCV3 Cap蛋白之间的同源性仅为26.5%-29.9%。通过比较PCVs Cap蛋白的同源性及对PCVs Cap蛋白的氨基酸序列进行比对分析,认为PCV2与PCV3不具有交叉保护性。本研究对广西健康屠宰猪的PCV2和PCV3的流行情况、分子流行特点及遗传进化进行了分析,进而为广西PCV2和PCV3的防控提供理论参考。