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杜氏肌营养不良症(简称DMD)是一种以X连锁隐性遗传为主要遗传方式的进行性肌无力和肌萎缩疾病,发病率为1/3500活产男婴,其中约1/3为新生突变。
目前较一致的观点是该病由抗肌萎缩蛋白(Dystrophin)基因突变引起。抗肌萎缩蛋白基因全长约2600kb,定位于Xp21,是目前发现的最大的人类基因,约占X染色体的2﹪,全基因组的0.05﹪。含79个外显子,DMD cDNA的长度为14kb,编码分子量427kd的蛋白。如此庞大的基因非常容易发生基因重排和重组。目前发现的基因突变存在多种类型,其中基因缺失占65﹪,基因重复占5﹪,点突变、小缺失及插入占30﹪。且突变的发生在整个基因非均匀分布,存在两个突变热区,即基因的5’端及Exon44-53之间。目前对该病尚无有效的治疗方法。
DMD主要遵循X连锁隐性遗传方式,女性携带者有50﹪的机会遗传给后代,遗传该突变基因的男性后代则成为患者,女性后代则是携带者。胚胎植入前遗传学诊断(Preimplantation genetic diagnosis,PGD)技术为DMD女性携带者生育健康后代提供了新的选择,与既往常规的产前诊断不同,PGD技术可避免因患病胎儿而需终止妊娠。PGD是建立在体外受精与胚胎移植(In vitro fertilization andembryo transfer,IVF-ET)的基础之上,在6-8细胞阶段的胚胎活检1-2个细胞用于遗传学检测,移植基因经检测证实没有疾病的胚胎。但由于Dystrophin基因庞大、突变种类多、基因内重组和新生突变发生率高,该疾病的胚胎植入前遗传学诊断还面临一定的困难,到目前为止还没有一个统一的方案。采用全基因组扩增(Whole genome amplification,WGA)作为胚胎植入前遗传学诊断的第一步,增加起始模板量,然后再检测多个基因位点,可以大大增加单细胞分析的准确性和可靠性。
目前已有多种WGA方法,如引物延伸预扩增(Primer extensionpreamplification,PEP)和简并寡核苷酸引物PCR(Degenerated oligonucleotideprimed PCR,DOP-PCR)。由于非特异性扩增产物、对整个基因组覆盖不全、DNA产物片段长度短等限制其在PGD中的应用。多重置换扩增(Multiple displacementamplification,MDA)是1998年由耶鲁大学Lizardi博士首次提出,该法不以PCR为基础。这种恒温扩增的方法依赖于链置换扩增原理,利用噬菌体Φ29DNA聚合酶,该酶强大的向前延伸活性和高保真度使得通过MDA可从极少量的DNA样本获取大量高质量的DNA,是到目前为止对整个基因组覆盖最广、各位点扩增偏倚最小的WGA方法。本实验研究的目的是探索MDA在胚胎植入前遗传学诊断中的应用,通过使用全基因组扩增的方法,克服胚胎植入前遗传学诊断中单细胞DNA量极少的瓶颈,解决单细胞模板量有限限制全面准确诊断的问题,建立DMD的胚胎植入前遗传学诊断方案,使该方案适用于各种基因突变类型的DMD女性携带者。
第一部分单细胞MDA结合单重荧光PCR方案评估。
目的:本研究针对单细胞MDA产物应用单重荧光PCR检测常见Dystrophin基因的缺失位点,选用多个基因内部的多态性位点行单体型分析,并同时行性别诊断,评估该方案在DMD胚胎植入前遗传学诊断中的可行性,建立适用于各种基因突变类型的DMD女性携带者的胚胎植入前遗传学诊断方案。
材料:
1.2005年10月至2006年12月于我院生殖中心就诊拟行PGD治疗的4个家系,均有DMD家族史和明确的基因检测结果,为基因缺失型突变或重复型突变。
2.本院生殖医学中心取卵后第三天正常受精的废弃胚胎。
方法:
1.外周血DNA抽提2.家系分析3.单个细胞制备4.单细胞MDA扩增5.MDA产物DNA总量测定6.MDA产物纯化7.在MDA产物应用单重荧光PCR检测17个基因位点(包括6个常见的缺失外显子,10个DMD基因内部的多态性位点,1个性别位点)。
结果:
1.家系来源的80个单个淋巴细胞(每例女性携带者各20个)及11个废胚来源的40个单个卵裂球进行MDA扩增,MDA扩增单个淋巴细胞的成功率为97.5﹪(468/480),扩增单个卵裂球的成功率为94.1﹪(640/680)。
2.将女性携带者来源的单个淋巴细胞MDA产物的PCR结果与其外周血结果比较,平均PCR扩增失败率为2.5﹪(12/480,变化范围0-5.0﹪),平均ADO率为12.0﹪(56/468,变化范围5.0-20.5﹪),两者各位点PCR扩增产物的片段大小一致。单个卵裂球MDA扩增产物进行17个位点的检测,其中6个外显子位点均有扩增信号,各位点平均扩增失败率为5.9﹪(40/680,变化范围0-15.0﹪)。同一个胚胎来源的不同卵裂球的扩增结果进行比较,确定杂合位点,计算平均ADO率为27.4﹪(37/135,变化范围0-37.5﹪)。
第二部分 DMD女性携带者胚胎植入前遗传学诊断。
目的:本研究部分基于前一部分研究结果,利用已建立的单细胞MDA结合单重荧光PCR的方案,对两例Dystrophin基因重复突变和缺失突变的女性携带者进行了PGD,以期获得Dystrophin基因正常的胚胎,使出生的婴儿真正健康。
材料:
两对夫妇均有DMD家族史,有将DMD遗传给后代的风险,前来我院生殖中心要求采用PGD技术生育健康后代,突变类型分别为外显子3-11重复和外显子47-50缺失。
方法:
1.控制性超排卵2.体外受精和胚胎培养3.胚胎活检4.单细胞MDA5.单重荧光PCR检测6.移植基因检测正常胚胎7.再次分析未移植胚胎。
结果:
1.病例1:超排后获取卵子19个,10个正常受精,取卵后第3天活检并分析6个胚胎。单细胞MDA产物进行位点STRMP、STR44、STR49及性别位点AMEL,的检测。结果显示2次ADO,分别在4号胚胎来源的卵裂球扩增位点STR49和6号胚胎来源的卵裂球扩增性别位点时发生。检测到两次扩增失败,位点STRMP和STR49各1次,且均发生在同一个卵裂球,该卵裂球取自6号胚胎。两个男胚遗传其母亲正常的Dystrophin单体,诊断为正常胚胎;两个男胚及两个女胚遗传其母亲基因重复的Dystrophin单体,分别诊断为患病胚胎及携带者胚胎。取卵后第4天向宫腔移植一个Dystrophin基因检测正常的胚胎,未孕。
2.病例2:超排后获取卵子14个,其中7个MII卵子行单精子卵胞浆内显微注射,7个正常受精,取卵后第3天共活检并分析6个胚胎。位点STR2、STR4-9、STR79GT2、STR3+33、EXON48及性别位点.AMEL用于遗传分析。位点STR2和STR3+33分别发生1次ADO,STR49和性别位点分别发生2次ADO,6次ADO中3次来源于取自3号胚胎的同一个卵裂球。直接检测突变区域内EXON48的结果与单体分析结果一致。两个男胚和两个女胚遗传其母亲正常的Dystrophin单体,诊断为正常胚胎;两个男胚携带有母亲基因缺失的Dystrophin单体,诊断为患病的胚胎。取卵后第4天向宫腔移植3个基因检测正常的胚胎,获得一例宫内单胎妊娠。于孕19<+>周取羊水细胞行产前诊断,证实为。DMD非携带者女胎。现孕21<+>周,胎儿发育良好。
两例临床病例的所有阴性对照PCR产物均未检测到阳性扩增信号。未移植胚胎均采用同种方法重新检测,结果与单个卵裂球诊断结果一致。
结论:
1.本研究在国内首次应用MDA于PGD技术中,获得一例临床单胎妊娠,该例妊娠亦是在单细胞水平通过全基因组扩增后对DMD携带者进行胚胎植入前遗传学诊断的首例成功妊娠报道。
2.单细胞MDA结合基因突变检测、单体型分析及性别诊断的方法,可以有效地应用于DMD的临床PGD,适用于大多数DMD女携带者,可以在鉴别正常男胚的同时分辨携带者和非携带者女胚,降低因基因重组引起的误诊风险及有效监测外源性DNA污染。