高校作为高素质、高技术水平人才聚集和培养的地方,它代表着高校的学科、科研的水平,反映着高校发展的后劲。与重点大学、传统老牌高校相比,与生俱来的经济基础底子薄、师资力量不雄厚等劣势是地方应用型本科院校他们必须面对的问题。2010年,包括高校在内的全国事业单位陆续全面实行绩效工资；2012年,安徽省高校绩效工资改革的序幕被拉开。在绩效工资改革的背景下,制定符合地方应用型本科院校可持续发展的激励制度,是这类高校在这竞争激烈的社会里,吸引人才,留住人才,进而培养出适合社会经济发展要求的应用型人才的一个重要举措。本文从我省地方应用型本科院校实际出发结合薪酬、激励理论,借鉴国内外同类院校激励制度,通过对巢湖学院激励制度及措施的现状分析,指出安徽省地方应用型本科院校大多存在的问题主要有：薪酬设置欠缺科学性、考核指标待完善、岗位设置不科学、激励形式过程单一等。之后,通过分析产生这些问题的内外因素,提出构建地方应用型本科院校激励制度的设想,内容包括完善绩效工资激励制度、结合本校实际选取适当的激励方式、针对不同的激励对象,制定不同激励政策及应当注意的问题等。