城镇黑臭河道由于含有大量脂肪、淀粉、蛋白质、纤维素、几丁质等有机污染物，导致河道水体严重富营养化、恶臭。因此，城镇黑臭河道治理的首要问题，是解决大量有机物造成的河水严重富营养化及黑臭问题。　　 本研究从土壤样品中分离、筛选出了能分解城镇河道水体中上述主要有机污染物的各菌种（假单胞菌，芽胞杆菌、乳酸菌，嗜麦芽窄食单胞菌，红球菌，苏云金杆菌）。对这些菌种和能固定并利用水中养分微生物分解产生氮磷的酵母菌，分别进行了降解城镇黑臭河道河水的实验室试验研究。试验结果表明，这些菌种能有效去除城市河流中的COD，加菌第1天、第3天、第5天和第10天后，水样COD平均去除率分别达到21.9％，47.9％，58.8％和62.7％。　　 以上述菌种为主要成份，研制了5种不同成份的复合菌剂，并在一实际黑臭河道中进行了应用测试。应用结果表明，添加复合菌剂15天后COD去除率达38～58％，其中以芽胞杆菌与酵母菌复合的复合菌剂4和复合菌5剂效果较好。复合菌剂1、复合菌剂2、复合菌剂3对总氮、氨氮、硝态氮和活性磷酸盐作用不明显，但复合菌剂4和复合菌剂5，可显著降低总氮、氨氮、硝态氮和活性磷酸盐浓度。此外，治理后，河道黑臭消除，水色接近于正常水体，透明度也显著提高，水体出现了大量的浮游动物，自净能力有所增强。