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体外胚胎生产技术以一种高效简单的辅助生殖技术获得广泛应用。体外受精技术是体外胚胎生产技术的重要组成部分。对动物养殖中的优良畜种的培育有重要的实践意义。同样玻璃化冷冻技术相比于其他冷冻保存方法具有花费较短的时间、简单易操作、产生较高的效率等优点,从而成为备受关注的技术。但体外生产胚胎与体内生产胚胎相比在卵裂率,妊娠率,产犊率等方面仍存在不足,这些可能与转录组异常相关(包括mRNA、lncRNA、circRNA)。本研究采用单细胞全转录组测序技术对牛体内生产的囊胚、新鲜牛卵母细胞体外培养受精的囊胚、玻璃化冷冻牛卵母细胞体外培养受精的囊胚进行全转录组分析(包括mRNA、lncRNA、circRNA),同时由获得的数据进行差异表达mRNA,lncRNA,circRNA的生物信息学分析并进行初步探索,本试验主要研究结果如下:1、对牛体内、外囊胚进行全转录组测序对其mRNA模式进行探讨及生物学信息分析,与In vivo组和IVF组中差异表达基因有78个,其中60个上调,18个下调;In vivo组和V_IVF组中差异表达基因表达362,其中305个上调,57个下调;IVF组和V_IVF组中差异表达基因14,其中13个上调,1个下调。对其差异表达基因进行GO注释发现,体内、外囊胚的差异表达基因的GO注释结果中,富集在rRNA加工、有机氮化合物代谢过程、有机氮化合物的生物合成过程等条目中,通过KEGG功能富集分析发现,在糖酵解/糖异生等通路中差异表达基因显著富集,在此通路上29个基因显著上调。2、对牛体内、外囊胚进行全转录组测序对其lncRNA模式进行探讨及生物学信息分析,与In vivo组相比,在IVF组中差异表达lncRNA有187个,其中表达上调数量有124,下调为63;与In vivo组相比,在V_IVF组中差异表达lncRNA为694,表达上调的数量为223,下调的为471;与IVF组相比,在V_IVF组中差异表达lncRNA为114,表达上调有27个,下调有87,对其差异表达基因进行GO注释发现,较多的基因富集到细胞生长发育、细胞骨架、ATP结合等条目中,通过KEGG功能富集分析发现,较多的基因在溶酶体、RNA转运以及氧化磷酸化通路,氧化磷酸化通路对早期胚胎发育和成功的妊娠结局至关重要。3、对牛体内、外囊胚进行全转录组测序对其circRNA模式进行探讨及生物学信息分析,获得994个circleRNA,这些circleRNA有437个靶向基因。IVF_Invivo组间表达差异的circleRNA的数量28,其中表达有2个表达上升,26个表达下降;V_IVF_Invivo组间表达差异的circleRNA的数量51,其中表达有2个表达上升,49个表达下降;V_IVF_IVF组组间表达差异的circleRNA的数量1,对其差异甲基化基因进行GO注释发现,较多的基因富集到染色体组织的正调控、组蛋白H3-K9甲基化的调控等通路上。