在砷的迁移转化过程中,微生物在其中扮演了很重要的角色。砷污染环境中土著微生物的群落结构特征和砷生物转化微生物的群落组成受到世界学者越来越多的关注。本文以内蒙古河套盆地高砷含水层中微生物群落为研究对象。通过采集不同区域的地下水和沉积物中的微生物样,分析这些样品的地球化学特征,研究样品中微生物群落结构特征和砷转化功能微生物群落组成,主要得到以下几点认识:(1)高砷地下水和低砷地下水中的微生物群落有显著差异。高砷地下水中微生物多样性和丰富度都高于低砷地下水。高砷样品中Chao范围为541～1933,而低砷样品中只有447～868。高砷地下水中主要的微生物是Sphingomonas、Pseudomonas Nitrospira、Rheinheimera,而低砷地下水中主要的微生物是Acinetobac、Thiovirga、Sulfurimonas,这些微生物主要跟N、S、As、Fe的生物地球化学循环有关。(2)地下水中微生物主要门是 Proteobacteria、Saccharibacteria、Bacteroidetes、Firmicrtes、Parcubacteria,主要属是Acinetobacter、Thiovirga、Aquabacterium、Hydrogenophaga、Sphingomonas。这些属在不同位置差异较大,Acinetobacter 主要分布在高砷地下水中,Aquabacterium在各口井中都有发现。ORP、TOC、SO42-、As(Ⅲ)、As(Ⅴ)和Mn是影响地下水微生物群落的主要环境因子。(3)沉积物中微生物的主要属Pseudomonas、Micrococcaceae、Massilia、Bacteroidales。pH、Mn、As、含水率、SO42-、NH4+、和 C/N 是影响沉积物中微生物群落的主要环境因子。地下水和沉积物中微生物群落结构在门和属水平上都有显著性差异;沉积物中微生物的多样性和物种丰富度都低于地下水中的微生物。(4)在内蒙河套盆地中,绝大多数砷功能微生物是未知的,已知的主要为Proteobacteria、Firmicutes和Actinobacteria。这些功能微生物除了可以还原砷、异化还原砷、氧化砷、甲基化砷外,还会参与硝酸盐还原,硫酸盐还原,铁还原。地下水的四种砷功能基因中,arsC和arrA基因的多样性和丰富度都远大于aioA和 arsM 基因。pH、ORP、TOC、SO42-、As(V)、As(Ⅲ)和 Mn 是影响砷功能微生物群落结构的主要环境因子。