KLF12、AIRE、AFF1、AFF3及ETS-1基因多态性与中国人群类风湿关节炎遗传易感性关联研究

来源 :安徽医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:pingpingkama
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种以累及周围关节为主的系统性自身免疫病。临床表现为受累关节肿痛,该病若不经及时、规范治疗,病情会进行性发展而导致关节软骨与骨质破坏,进而造成关节畸形与功能丧失,严重地影响患者生活质量。RA的发病涉及多种因素,大量研究表明遗传因素在RA的发生、发展中起重要作用,该病的遗传度高达60%左右。近年来,从人类基因组水平探索基因单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)位点与疾病遗传易感性之间联系的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)极大地丰富了我们对复杂疾病遗传易感因素的认识。迄今,已有多项GWAS发现并证实了几十个与RA遗传易感性相关的遗传易感区域/位点,但这些GWAS大多数是在欧美人群中开展的,尚未见我国RA的GWAS结果报道。一项在西班牙人群中开展的GWAS发现KLF12基因rs1324913位点与RA遗传易感性相关,此前,在英国人群中开展的GWAS发现KLF12基因rs1887346位点与RA遗传易感性相关,表明KLF12是RA的遗传易感基因。一项在日本人群中开展的GWAS发现AIRE基因的两个SNP位点(rs2075876和rs760426)与RA的遗传易感性相关,并且rs2075876位点与AIRE基因的转录水平相关。系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)与RA同属系统性自身免疫病,由于RA与SLE临床表型相似、家族聚集,表明RA与SLE可能存在共同的遗传背景,大量疾病间的遗传易感性验证研究也证实了RA与SLE确实具备相同的遗传易感因素。一项在日本人群中开展的GWAS和多阶段验证研究发现AFF1 rs340630与SLE遗传易感性相关且该位点风险等位基因A与AFF1基因转录水平上调相关。此前,与AFF1基因同属一个基因家族的AFF3基因启动子区域的rs10865035位点被报道与RA遗传易感性相关,随后一些研究也发现AFF3基因与RA遗传易感性相关。一项在中国汉族人群开展的GWAS发现ETS-1rs6590330位点与SLE遗传易感性相关,另一项在亚洲人群中开展的GWAS发现ETS-1 rs1128334位点与SLE遗传易感性相关,该位点与rs6590330位点高度连锁且位于3’-非翻译区(untranslated region,UTR),其风险等位基因A与正常人外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中ETS1基因的转录水平下调有关,表明ETS-1 rs1128334位点是一个功能性SNP位点。目的鉴于种族间的遗传异质性、RA与SLE具备共同的遗传易感因素,且尚未见国内有研究报道KLF12 rs1324913、KLF12 rs1887346、AIRE rs2075876、AIRE rs760426、AFF1 rs340630、AFF3 rs10865035及ETS-1 rs1128334位点与中国人群RA遗传易感性之间的关系,故本研究拟采用病例对照研究,通过检测RA患者与对照中上述SNP位点,分析各SNP位点基因型频率分布与等位基因频率分布在RA病例组与对照组间的差异,并进一步分析各位点风险等位基因在不同遗传模型(显性遗传模型与隐性遗传模型)下与RA遗传易感性之间的关系,以期为我国人群RA遗传易感性研究提供本底资料,并为进一步开展相关分子致病机制研究提供科学依据。方法本课题采用病例对照研究设计,RA病例为安徽省六安市人民医院风湿免疫科的门诊RA患者,所有病例均符合美国风湿病协会(American College of Rheumatology,ACR)1987年修订的RA分类标准。对照为六安市人民医院骨科门诊因外伤就诊者。研究对象知情同意后,按照性别与年龄信息的一般人口学特征,收集RA患者的资料,同时抽取外周静脉血5ml,提取研究对象基因组DNA。运用专业SNa Pshot SNP技术检测基因多态位点。采用Excel 2003软件录入资料。运用STATA12.0软件评估对照组中各SNP位点的基因型频率分布是否符合哈迪-温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)。使用SPSS 11.0软件进行t检验、卡方检验和logistic回归分析。关联强度以比值比(odds ratio,OR)及其95%置信区间(confidence interval,CI)表示。以α=0.05为一类检验水准,采用Bonferroni法在多重比较时对检验水准进行矫正,因本次研究共有7个SNP位点,所以矫正后的检验水准为0.05/7=7.14×10-3。结果(1)研究对象一般情况:本研究共纳入RA患者232例,对照313例。RA患者中男性45例,女性187例,年龄最小者14岁,最大者80岁,平均年龄为(48.69±14.18)岁。RA患者中RF阳性154例,RF阴性78例;CCP阳性228例,CCP阴性4例。对照组中男性197例,女性116例,年龄最小者2岁,最大者91岁,平均年龄为(47.02±16.34)岁。RA病例组与对照组的性别构成有统计学差异(χ2=102.33,P<0.01),而平均年龄无统计学差异(t=1.28,P=0.20);(2)HWE检验:7个基因多态性位点在对照组中的基因型频率分布均符合HWE(KLF12 rs1324913位点:c2=0.34,P=0.56;KLF12 rs1887346位点:c2=2.67,P=0.10;AIRE rs2075876位点:c2=0.11,P=0.74;AIRE rs760426位点:c2=0.02,P=0.89;AFF1 rs340630位点:c2=4.20,P=0.04;AFF3rs10865035位点:c2=4.76,P=0.03;EST-1 rs1128334位点:c2=2.26×10-3,P=0.95);(3)各基因多态性位点与RA遗传易感性之间的关联研究结果:考虑到RA病例组与对照组间性别构成存在统计学差异,我们在分析RA病例组与对照组间的基因型频率分布差异、风险等位基因在不同遗传模型(隐性遗传模型与显性遗传模型)下与RA遗传易感性的关联情况时在性别上进行了矫正,研究结果显示AIRE rs2075876位点的基因型频率分布(χ2=8.22,P=0.02)与等位基因频率分布(A vs.G:χ2=5.30,P=0.02,OR=1.33,95%CI 1.04-1.69)在RA病例组与对照组间均存在统计学差异,且该位点风险等位基因在显性遗传模型下与RA遗传易感性之间存在统计学关联(A/A+G/A vs.G/G:χ2=7.24,P=7.15×10-3,OR=1.78,95%CI 1.17-2.70);AIRE rs760426位点的基因型频率分布在RA病例组与对照组间存在统计学差异(χ2=6.46,P=0.04),且该位点风险等位基因G在隐性遗传模型下与RA遗传易感性之间存在统计学关联(G/G vs.G/A+A/A:χ2=5.38,P=0.02,OR=1.73,95%CI 1.09-2.76)。然而,经Bofferroni法矫正后仅有AIRE rs2075876位点A等位基因在显性遗传模型下与RA遗传易感性之间的关联结果经Bonferroni法矫正后边缘显著。未发现其余5个基因多态性位点与RA遗传易感性相关。结论本研究发现AIRE rs2075876位点、AIRE rs760426位点与我国人群RA遗传易感性相关,但经Bofferroni法矫正后仅有AIRE rs2075876位点A等位基因在显性遗传模型下与RA遗传易感性之间的关联结果经Bonferroni法矫正后边缘显著。AIRE基因可能是我国人群RA的一个遗传易感基因,将来有必要采用大样本研究来证实AIRE是否确实是我国人群RA的遗传易感基因。本研究尚未发现KLF12rs1324913、KLF12 rs1887346、AFF1 rs340630、AFF3 rs10865035及ETS-1 rs1128334位点与我国人群RA遗传易感性相关,这些基因是否与我国人群RA遗传易感性相关有待将来采用大样本的精细定位研究进行验证。
其他文献
<正>毛主席《在延安文艺座谈会上的讲话》发表50周年前夕,我重新学习了《讲话》,回忆了走过来的路程,感到格外亲切、愉悦.因家境苦寒,识字无几.进入革命队伍之后,家里不再受
矿区地处印度尼西亚爪哇岛中-新生代火山岛弧带西端,属西爪哇近东西向茂物至吉古德渐新世-全新世构造岩浆带。矿体主要赋存于Qvu英安质-流纹质火山岩中断裂带中。Ⅰ号矿体位
作为当前最具创新性、融合性和前沿性的科技领域之一,信息与电子领域近年来发展迅速,且对很多领域都产生着深刻的影响,因此,做好该领域的技术预见工作尤为重要。本文依托“中国工
目的探究产前诊断中妊娠中期性染色体嵌合体发生几率及其妊娠结局情况。方法以2015年6月-2018年1月期间入院行产前检查的4987例妊娠中期孕妇为研究对象,回顾性分析孕妇羊水染
近年来,随着网络舆论影响的不断扩大,网络舆论危机事件不断增多,社会各界从理论和实践层面作出了积极思考,但客观现实仍需要我们不断创新认识,深化对网络舆论危机的规律性把
随着市场经济的不断发展,人民生活水平日益提升,收入不断增加,生活的理念发生了变化,健康的理念不断深入人心,人民的体育娱乐休闲模式发生了根本的变化,不再是简单的跑跑步、
随着近几年我国高职教育规模的急剧扩大,高职教育在满足大众化高等教育需求的同时,各种质量问题也随之不可避免地暴露出来,传统的教育质量管理受到严峻的挑战。如何保障高职
随着世界经济一体化、区域化的日益增强 ,世界政治、文化全球化、区域化的发展趋势也越来越明显加快。由于交通技术的革命 ,人类“缩短”了彼此之间的距离 ,基于信息技术的电
警务微博,是公安机关依托微博这一新兴网络媒体阵地,发布警务资讯、突发警情、安全防范等信息,提供民众咨询、救助等服务内容,搭建群众参警议警、警务协商、民主监督的平台。
银杏提取物已广泛应用于治疗心脑血管疾病。然而基于一些研究成果,银杏提取物还具有抗肿瘤的活性,能够抑制包括血液系统恶性肿瘤白血病在内的一部分肿瘤的生长。本文旨在介绍