从太平洋深海沉积物筛选到一株产蛋白酶的菌株Bacillus sp. EPPRO6,该细菌细胞在电子显微镜下呈短杆状,无鞭毛,单个排列,大小为1.61.8μm×2.53.0μm,为革兰氏阳性菌。该菌能够利用多种碳源和氮源并产生蛋白酶,尤其在酪蛋白底物的诱导作用下,该菌株能够产生大量胞内的蛋白酶。粗酶液经硫酸铵盐析,Sephadex G-75凝胶柱层析后,获得了单一条带的电泳纯酶,其分子量大小约为34 kDa,并对纯化后的蛋白酶进行酶学性质的研究。该蛋白酶的最适反应pH值为89,最适反应温度为60℃,是典型的中温碱性蛋白酶,对热不敏感,具有很高的热稳定性,60℃保温1h后酶活仍剩余50%,Ca2+能够很大程度上提高该蛋白酶的热稳定性。Co2+,Mg2+,Ca2+等离子对蛋白酶有较为明显的激活作用,Fe3+、Hg2+、Cu2+等则能抑制蛋白酶活力。10 mmol/L的金属离子螯合剂EDTA和丝氨酸蛋白酶抑制剂PMSF和AEBSF对该蛋白酶显示一定的抑制作用,而半胱氨酸蛋白酶抑制剂E-64对此酶无抑制作用,该酶有一定耐受尿素和二巯基丁二醇的能力。利用PCR技术扩增出了相关蛋白酶的8个基因片段,并采用染色体步移的方法获得了5个相关蛋白酶的开放阅读框（ORF）,进行序列比对和保守区域分析后,分别为胞内丝氨酸蛋白酶,肽酶M4,CAAX氨基末端蛋白酶,中性蛋白酶B和微生物胶原蛋白酶。根据完整的蛋白酶基因,设计了表达引物,构建重组质粒,转化到E.coli BL21中,其中3个蛋白酶基因得到了表达,蛋白质电泳结果显示,表达出的蛋白质均符合预期的大小。其中胞内丝氨酸蛋白酶获得可溶性表达,并经酶活检验,均有丝氨酸蛋白酶的性质。本实验中尝试利用传统的紫外诱变的方法,对该野生型菌株诱变,获得理想中的更加耐碱或者耐酸的高稳定性的菌株。该菌株产生的蛋白酶,种类多,活力高,稳定性良好,具有潜在的工业应用价值。