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目的:利用多位点可变数目串联重复序列分析(The Multiple Locus VNTR Analysis,MLVA)的技术对新疆部分地区人群中确诊肺结核(PTB)患者的痰液进行基因组序列检测,以及相关聚类分析,以大体得出新疆部分地区的结核分枝杆菌(MTB)菌株基因类型及其分布情况,同时得到成簇菌株的分布特点。方法:采用多阶段分层整群等比随机抽样的方法,对选定调查点的15岁以上常住人口进行症状调查和拍摄胸片,对所有胸片异常者及有PTB可疑症状者,收集其痰标本进行3次痰涂片检查(即时、晨、夜)及2次痰培养,对培养阳性的痰标本行MTB菌种鉴定、提取基因组DNA,然后采用MLVA的方法,同时选取经典24位点方法对菌株DNA序列进行检测,最后应用BioNumerics5.0软件对基因检测结果进行相同基因型聚类。结果:研究共抽取了22个调查点,发现疑似结核者1571人,其中活动性TB 475例,涂阳TB 50例,菌阳TB 103例,除去4例NTB,研究中共纳入的99株痰培养阳性的MTB菌株,经过对纳入菌株的基因分型结果聚类后分析,结果显示:培养阳性的MTB菌株可以被分成2个基因群,即I群、II群,分别所占比例为66.7%(66/99)、33.3%(33/99)。而且在I群中发现有2个菌株来源相同,可成一簇,成簇比例为1.5%,而剩余的MTB菌株没有发现成簇,表现为“唯一型”。结论:通过本研究我们初步对新疆MTB进行基因分型,且证实MTB菌株基因类型分布具有多态性,我区主要流行菌株为北京基因型,同时还有小部分的非北京基因型,相关结核防控部门应加强对北京型菌株的防治及监测。