白血病新融合基因PAX5-UBE2D4的克隆及功能研究

来源 :苏州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:woshizhuwoshizhu
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目的:1.检测65例初诊急性B淋巴细胞白血病及19例染色体核型分析为9p13异常患者中PAX5基因重排的发生率,并分析其临床特点及实验室特征。2.从一例伴dic(7;9)(p11-13;p13)的混合表型急性白血病的研究入手,定位克隆PAX5的新对手基因及融合基因,并对其新融合基因进行初步功能研究,以深化我们对PAX5相关融合基因致白血病发生、发展机制的认识。3.分析BCR/ABL1阳性急性白血病中BTG1基因缺失的发生情况,阐述伴有BTG1基因缺失的BCR/ABL1阳性急性白血病的临床及实验室特征,初步探讨BTG1缺失与BCR/ABL1阳性急性白血病的发病及复发的相关性。方法:1.通过R显带技术对84例患者骨髓标本进行核型分析,并选用位于9p13PAX5基因两端的RP11-344B23和RP11-652D9克隆,常规抽提DNA,采用缺口平移法标记荧光素,应用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)对65例B-ALL及19例伴有abn(9p)异常的患者进行PAX5基因重排或缺失筛选,并分析其临床及实验室特征。2.收集7例伴有dic(7;9)的患者骨髓标本,其中4例应用DNA抽提试剂盒(Invitrogen公司生产)抽提基因组DNA,各自送检至少1.5ug DNA于上海伯豪生物技术有限公司,选用安捷伦人类比较基因组芯片(Agligent Technologies,SantaClara,CA,USA,244K)对4例患者进行Array-CGH技术检测,同时应用送检公司所提供的软件(Agilent Genomic Workbench Lite Edition6.5software)进行数据与图像的分析,明确7号和9号染色体的重排情况;利用RT-PCR验证易位中PAX5新对手基因(位于7p13的UBE2D4基因);设计引物并利用KOD高保真酶扩增出PAX5-UBE2D4融合基因全长,根据后续功能研究的需要分别将PAX5-UBE2D4及BCR/ABL两个融合基因全长克隆到慢病毒载体LV5。采用慢病毒包装体系包装PAX5-UBE2D4及BCR/ABL病毒,并用病毒侵染NIH-3T3细胞及小鼠原B细胞BaF3细胞株,成功构建过表达PAX5-UBE2D4、BCR/ABL、PAX5-UBE2D4+BCR/ABL三种稳转细胞株,通过Western Blot验证蛋白表达情况,绘制生长曲线、甲基纤维素集落形成实验、实时定量PCR等情况观察这些对NIH-3T3及BaF3细胞的恶性转化能力。3.收集2001-2013年期间在苏州大学附属第一医院住院诊断和治疗的BCR/ABL1阳性急性白血病44例,选用安捷伦人类比较基因组芯片对22例患者进行Array-CGH技术检测,并对这44例患者的骨髓标本mRNA,利用RT-PCR精确定位BTG1基因缺失位点,并总结BTG1缺失组患者的临床及实验室特征,分析其与发病机制及复发的相关性。结果:1.伴随9p13/PAX5重排患者的临床及实验室特征65例B-ALL及19例9p13异常患者中PAX5基因缺失的有20例(23.8%),PAX5基因易位的有2例(2.4%),PAX5基因扩增1例(1.2%),总的异常率为27.4%(23/84)。伴有t(9;22)的PAX5基因重排阳性率高于不伴有t(9;22)的PAX5基因重排率,PAX5基因重排在不同性别、年龄及不同白细胞、血红蛋白及血小板水平,差异均无统计学差异(P值均>0.05)。2.PAX5-UBE2D4融合基因的克隆及功能研究应用FISH技术、比较基因组杂交芯片、RT-PCR和基因测序技术对其中1例患者白血病细胞dic(7;9)(p11-13;p13)的断裂点进行精确定位,克隆到一个新的累及PAX5和泛素结合酶UBE2D4的融合基因,PAX5-UBE2D4。该融合基因由PAX5的1-7号外显子和UBE2D4的2-7号外显子融合而成,且UBE2D4基因的开放阅读框出现移码后提前终止。通过分子克隆及细胞培养技术,利用携带PAX5-UBE2D4及BCR/ABL慢病毒载体的质粒转染NIH-3T3细胞及BaF3细胞,对其生物学特性进行检测后发现,PAX5-UBE2D4能促进细胞的生长,且能在甲基纤维素半固体培养基形成集落,同时PAX5-UBE2D4可使BaF3细胞减少对IL-3的依赖。Western Blot结果显示,PAX5-UBE2D4融合蛋白主要表达在细胞核,在细胞浆可少量表达,融合蛋白大小约55KDa。通过定量PCR检测PAX5的表达,感染组细胞均表现为PAX5高表达。3.BTG1基因缺失在Ph阳性急性白血病中的发生率及作用在44例初治的BCR/ABL1阳性急性白血病中,共有14例患者出现BTG1缺失(14/39,31.8%),包括10例BCR/ABL1阳性的急性B淋巴细胞白血病(10/32,31.3%),2例混合表型急性白血病(2/6,33.3%),2例慢性粒细胞白血病急变期(2/6,100%)。在此研究中,共精确定位5种BTG1缺失断裂位点,从第284个至第304个碱基,横跨20个碱基对,形成截短型BTG1转录本。在BTG1缺失型及野生型患者相比较,两组在外周血WBC计数、Hb水平、PLT计数、骨髓原始细胞比例、性别、年龄及化疗的总体缓解率方面的差异均无统计学意义。结论:1.本实验通过对急性B淋巴细胞白血病中PAX5基因异常进行FISH筛选,发现PAX5基因异常是急性B淋巴细胞白血病中最常见的一类遗传学异常,还可见于AML-M2,同时常伴随常见的再现性遗传学异常,如t(9;22)(q34;q11),在B细胞的发育分化及增殖过程起协同作用,诱发B-ALL的发生发展。2.发现一种累及PAX5基因的新获得性染色体易位:dic(7;9)(p11-13;p13)。该易位基因组水平的断裂点分别位于PAX5第7内含子及UBE2D4第1内含子之间。与野生型PAX5蛋白一样,PAX5-UBE2D4的融合蛋白位于细胞核内,对PAX5的转录活性可能有一定影响,PAX5-UBE2D4融合蛋白能使BaF3细胞获得增殖优势,协同表达的BCR/ABL蛋白可抑制细胞的粘附和凋亡,促使细胞不依赖于细胞生长因子而过度增殖。3.BTG1基因缺失在BCR/ABL1阳性急性白血病中的发生率可达33.3%,高于国外报道,本研究首次发现在MPAL及CML-BC(B系)中也存在BTG1基因缺失。BTG1基因缺失可能在BCR/ABL1阳性急性白血病的发病及复发过程中扮演一个很重要的角色。
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