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两岸农业合作的过程中,除了理论上生产要素的互补外,如何发挥各自的比较利益,促使两岸农业的同步发展,将是两岸农业合作可长可久的重要关键。同时,两岸在农业合作的过程中,必须两者都能由合作的过程中获得利益,才能化解人民在两岸合作的过程中所产生的种种疑虑。因此,本研究首先利用时间序列分析法,针对农业投资及农产品出口资料进行单根检定;若数据皆为一次差分稳定则进行协整分析、若数据不具协整关系则进行自我回归模型分析,若数据具有协整关系则进行误差修正模型分析,以探讨台湾对中国大陆进行农业投资,与台湾农产品出口美国及日本市场金额的关联性。其次,针对台湾及大陆在美国及日本市场的农产品出口金额,利用简化的固定市场份额模型进行拆解,以得到其竞争效果,同时,利用时间序列模型,探讨台湾对中国大陆进行(广义及狭义)农业投资金额,与台湾农产品出口主要国际市场(美国、日本)竞争效果的关联性。本文的主要发现有:首先,赴大陆狭义农业投资与台湾及中国大陆农产品出口美国与日本的金额,具有协整关系。透过赴大陆狭义农业投资与台湾农产品出口美国与日本市场的金额,可以发现,在长期间赴大陆狭义农业投资,对台湾及中国大陆农产品出口美国与日本市场的金额均有正向影响,此一结果表示,台湾赴大陆进行农业投资,有助于中国大陆外向型农业的出口能力提高,因此,具有正向影响。另外,由于台湾生产成本较高,而不具竞争力的农产品外移中国大陆,将会释出农业资源,并移转至具有竞争力的农产品生产,因此,台湾赴大陆农业投资,也将促进台湾长期在美国以及日本市场的出口。至于在短期间,在赴大陆狭义农业投资与台湾农产品出口日本金额关系上,可以发现,在短期间赴大陆进行狭义农业投资对于台湾农产品出口日本市场金额的影响系数为-0.0920,显现台湾赴大陆进行狭义农业投资将可能会对台湾农产品出口日本市场产生不利的影响。在广义农业投资与台湾在美日的出口影响关系上,可以发现,台湾对日本及美国出口金额一旦提高时,短期内将使得对陆投资金额上升。其可能原因是,当对美日的出口金额畅旺的情况下,投资人将更有动机赴大陆投资。其次,在固定市场份额模型的出口竞争效果分析上,本研究发现:短期而言,台湾在美国及日本的竞争效果,与中国大陆在美国及日本的竞争效果,并没有相互影响;也就是说,两岸在美国与日本市场上,所表现出来的出口结构,并非呈现直接竞争的情况。同时,狭义与广义赴大陆农业投资,对于台湾农产品出口美国与日本的竞争效果并没有影响;此一结果表示,台湾在美日市场竞争力的变动,并非来自于赴大陆进行农业投资所带来的结果。有可能是由于汇率、工资等方面,所带来的影响,这一点还需要后续的研究来深入探讨。两岸过去因为历史因素,甚少携手合作开扩农产品的国际市场,无法有效利用两岸农业生产资源,扩大两岸农业的国际竞争力。两岸农渔业若能进行合作,共同来开扩市场,不仅可降低两岸农渔产品在国际市场上互相厮杀的局面,同时也能提升两岸农渔民的所得与技术,另一方面,对台湾而言,善用大陆的优势。台湾农业的优势在于品种、技术、资金、气候具备多样性、人才的教育训练以及市场拓销经验;中国大陆则是土地丰富、低阶人力充沛、气候具备多样性。台商若能以台湾作为农业技术、品种研发的根据地,结合中国大陆广大的土地与劳动资源,透过两岸气候多样性的生产调适,将有利于农产品外销数量的拓增。