本研究以我国南方主要的水产养殖致病菌-溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)为研究对象，通过比较蛋白质组学研究溶藻弧菌全菌蛋白和分泌蛋白，以期筛选溶藻弧菌毒力相关分子，并对毒力相关分子与菌株的毒力相关性做了评估。此外通过免疫蛋白质组学对溶藻弧菌与哈氏弧菌和副溶血弧菌的共同抗原进行筛选，并对免疫保护性进行初步的研究，为安全、有效的溶藻弧菌新型疫苗研制奠定了技术平台。　　 本文成功提取溶藻弧菌的全细菌蛋白，建立了凝胶双向电泳技术平台，同时采用高效液相色谱(非凝胶)联合二级串联飞行时间质谱(LC-MALDI)技术鉴定溶藻弧菌全菌蛋白，共成功鉴定600个溶藻弧菌蛋白，为该菌蛋白质组学的研究提供了数据平台。　　 采用荧光差异双向电泳成功地对溶藻弧菌强毒株HY9901和无毒株HY12进行分析，质谱鉴定了其中的68个强毒株特有的蛋白质点，获得了66个ORF。此外用LC-MALDI共鉴定得到278种毒力株特有的蛋白，对它们进行细胞定位发现具有信号肽的蛋白有29个，内膜蛋白71个，细胞质178个，外周质17个，外膜12个。对鉴定得到的278个蛋白点进行功能分析，结果发现能量代谢和运输蛋白最多，占43％；其次是转运和结合蛋白占9％；第三是外膜蛋白占8％，为进一步深入研究溶藻弧菌的毒力机制奠定了基础。　　 应用LC-MALDI比较蛋白质组学技术，对溶藻弧菌强毒株HY9901和无毒株HY12胞外产物进行比较分析，获得强毒株HY9901特有的不同于HY12的蛋白共有175种，用SignalP3.0 Server对蛋白进行信号肽预测，在139种培养上清鉴定的蛋白中预测有信号肽的蛋白65种，占全部蛋白的37.1％。对它们进行细胞定位发现有33个位于外膜，19个位于内膜，54个位于细胞质中，33个位于外周质。蛋白的功能分类表明运输蛋白最多，占20％，其次是蛋白命运，占13％，第三是未分类蛋白，占12％，这些未分类蛋白均为首次在实验水平得到了验证，这些数据为分泌组的研究提供了蛋白水平的数据支持。　　 选择15个毒力相关基因进行克隆和序列分析，获得8个基因的开放阅读框(open reading frame，ORF)，并对它们进行了全面的生物信息学分析。密度感应基因luxR的ORF长732bp，编码243aa。荚膜多糖合成蛋白cpsB的ORF长1191bp，编码396aa。荚膜多糖合成蛋白cpsD的ORF长2181bp，编码726aa。摄铁基因exbB的ORF长660bp，编码219aa。不依赖tonB的摄铁相关基因tolB的ORF长1353bp，编码450aa。鞭毛蛋白基因flgL的ORF长900bp，编码299aa。hutB的ORF长825bp，编码279aa。ompH的ORF长573bp，编码190aa。它们与GenBank报道溶藻弧菌对应基因的同源性在94％以上，仅存在个别碱基的突变。此外得到7个毒力相关基因的片段，它们是呋喃糖基硼酸二酯(密度感应基因)luxS，鞭毛蛋白基因flaE，鞭毛蛋白基因flg，外膜蛋白ysc，溶血素tlh，外膜蛋白yscC，毒素dtd。运用荧光定量PCR观察这15个基因在溶藻弧菌强毒株和无毒株中的表达情况，发现鞭毛蛋白基因flaE、flgL和flgI，毒素基因tlh，dtd，血晶素结合蛋白hutB，摄铁系统相关基因exbB，tolB，密度感应基因luxS，这些基因与溶藻弧菌的毒力呈相关性。而三个外膜蛋白基因yscC，yscO，ompH，荚膜多糖合成基因cpsB和cpsD，密度调控基因luxR，这些基因除HY12菌株外，在其余菌株中均有表达，而且在mRNA水平与溶藻弧菌的毒力无相关性。　　 运用免疫蛋白质组学成功地对HY9901的全细菌蛋白用兔抗溶藻弧菌血清进行研究。在4