土地承包经营权确认纠纷是一类特殊的农村土地承包经营纠纷。由于其他种类的土地承包经营纠纷处理,通常都以承包经营权权属确定为前提,所以农村土地承包经营权确认纠纷地成功化解至关重要。土地承包经营权确认纠纷在《农村土地承包经营纠纷调解仲裁法》中有明确规定,但未见于最高院关于审理农村土地承包案件的司法解释中。根据相关法律规定及土地承包仲裁与诉讼的关系,土地承包经营权确认纠纷也应当属于民事诉讼管辖,但在实践中,土地承包经营权确认纠纷却存在与土地使用权权属争议、未实际取得土地承包经营权等案件区分混乱等问题,这些争议不属于民事诉讼受案范围,而是应当由政府处理,进而导致有些纠纷经过土地承包仲裁后被法院“推给”政府部门,政府部门又认为应当由法院进行审理。因法律规定不清、事实认定困难等原因,导致当事人纠纷无法实质化解、土地承包仲裁并未发挥实际作用的局面。这就需要厘清土地承包经营权确认纠纷与土地使用权争议、未实际取得土地承包经营权等问题的关系,有效发挥调解、土地承包仲裁等非诉途径在案件分流、纠纷化解方面的作用。与其他土地纠纷一样,土地承包经营权确认纠纷的产生有其经济、历史与法律的根源,并且表现出基础性与复杂性的特点。此外,土地承包经营权确认纠纷在实践中还有些常见的类型,比如由于发包不规范引起的、土地四至边界问题引起的、发包方调整承包地引起的等。土地承包经营权确认纠纷与土地使用权争议是根据不同性质的法律关系而产生的纠纷,二者所适用的法律不同,处理方式也不同,并且未签订土地承包合同的纠纷不应属于土地使用权争议,不论其属性如何,都应当通过土地承包仲裁进行解决。未实际取得土地承包经营权的情形包括因集体经济组织成员资格、二轮土地承包未取得承包地的情形,但不包括承包时未签订土地承包合同的情形。目前与土地承包经营权确认纠纷相关内容的法律规定包括《农村土地承包法》《民法典》《土地管理法》及相关的司法解释,但在处理土地承包经营纠纷（包括土地承包经营权确认纠纷）时还存在法律内在冲突、不适应现实情况、事实认定困难及纠纷解决机制运行不畅的问题。所以,应当从完善土地纠纷化解的纠纷解决机制与保障纠纷有效化解的外部机制两个方面着手,通过立法详细规定行政调解的程序及赋予行政调解强制力的方式去加强乡（镇）政府调解这种行政调解在化解土地承包经营权确认纠纷时的作用;通过将土地承包仲裁作为诉讼的前置程序以及在土地承包经营权确认纠纷和有仲裁协议的情形下赋予土地承包仲裁一裁终局的效力去发挥土地承包仲裁的作用;通过完善土地管理方式与制度、提升基层的法律服务水平、加强人才培养力度这些外部保障手段,充分发挥调解与土地承包仲裁的作用,减轻诉讼压力,更好地利用司法途径最后一道防线的作用,公正实质地化解土地承包经营权确认纠纷。