效益审计作为现代审计的核心内容，日益得到各国的重视。审计署2003年7月发布的《审计署2003至2007年审计工作发展规划》预示着审计工作开始由纠错防弊向效益性、效果性转变，效益审计将成为现代审计的主流，代表审计工作的发展方向。 然而，如何科学有效地实施效益审计，为本地区社会与经济的持续健康发展提供有质量、有效果的审计监督。这已经成为各级审计机关面临的实践问题。但目前对效益审计的理论研究大多数仍停留在效益审计产生的背景、审计制度的探讨等方面，对效益审计指标体系、方法选择的研究也不多，对效益审计实践的指导作用还不是很突出。本文是在对国内外研究现状进行分析后，并结合我国实情的效益审计下进行的研究，旨在促进效益审计有效实施和更为广泛应用。 首先，本论文是在前人关于效益审计大量研究的基础上，对效益审计进行不同层次的分析，包括最基本层面(支出性控制)、专业理性层面(分析对比性审计)和成本控制配合功能创新的价值创造的层面(价值审计)；其次，将价值工程方法引入，并探讨价值工程和效益审计相结合的评价思路和评价方法。另外，注意将审计案例贯穿于文中，进行实证分析，以使效益审计的方法更好地与实践结合。 本文通过研究，最终得出结论：将效益审计划分为三种不同的层次，将更加有益于当今效益审计的有效实施和广泛应用；从理论上讲，将价值工程融入企业效益审计中使企业增加价值是可行的，这在研究方法上是一种新的尝试，能够进一步充实和发展效益审计的方法。