高效烷烃降解菌XCZ的分离、鉴定及其烷烃单加氧酶基因alkB功能的研究

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本研究从原油中分离筛选到一株高效烷烃降解菌XCZ,经形态观察、生理生化特征、16S rDNA序列分析等将其初步鉴定为铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)。XCZ能以正十八烷为唯一碳源生长,在含500mg/L正十八烷为唯一碳源的培养基中培养40h后正十八烷降解率达97.5%。XCZ降解正十八烷的最适温度为37℃,最适pH值为7.0。XCZ可以降解高浓度原油(2g/L)中C13-C32的直链烷烃,其中对C13-C24烷的降解率大于80%。从P.aeruginosa XCZ的基因组DNA中扩增到了烷烃单加氧酶基因alkB1、alkB2,与模式菌株P.aeruginosa PAO1中的alkB1、alkB2基因同源性均大于99%。为了进一步研究P.aeruginosa中alkB1、alkB2基因在烷烃降解中所起的作用,分别构建了两个用于突变P.aeruginosa XCZ中alkB1、alkB2基因的自杀式质粒:pEXB1’K用于突变alkB1基因,pJQB2’T用于突变alkB2基因。利用三亲接合的方法将两个同源重组质粒分别导入P.aeruginosa XCZ中,得到了alkB1基因单突变菌株B1M、alkB2基因单突变菌株B2M;将pJQB2’T导入B1M中得到了alkB1/alkB2基因双突变菌株B12M。Southern杂交的结果显示在P.aeruginosa XCZ中只存在单一的alkB1、alkB2基因拷贝;B1M、B12M中的alkB1基因以及B2M、B12M中的alkB2基因已经被成功的突变了。通过比较野生菌株及突变菌株在不同烷烃中的生长情况,分析了P.aeruginosaXCZ中alkB1、alkB2基因的烷烃降解范围及其降解能力。研究发现双突变茵株B12M失去了对C13-C16烷的降解能力,但仍然能够降解C17及以上的烷烃,说明在P.aeruginosa XCZ中还存在其它的烷烃降解基因,它(们)能够降解C17及以上的烷烃,而alkB1、alkB2基因对于C16及以下烷烃的降解是必需的。B1M、B2M均能够利用C13-C30烷生长,它们在C14-C20烷为唯一碳源培养基中的生长速率大于B12M而小于野生菌株,但在C22-C32烷为唯一碳源培养基中的生长速率却与B12M及野生菌株无明显差异。这说明P.aeruginosa XCZ中的烷烃单加氧酶AlkB1、AlkB2的烷烃降解范围可能都是C13-C20烷,它们均不能降解C22及以上的烷烃。B1M在C14-C20烷为唯一碳源培养基中的生长速率要快于B2M,说明对于C14-C20烷的降解,alkB2基因相比alkB1基因起着更大的作用。B2M对C13、C14烷的降解效率很低,所以C13、C14烷的降解主要依赖于AlkB2。
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