5例SLC12A3基因复合杂合突变致Gitelman综合征患者二代测序及基因突变分析

来源 :苏州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liu3352
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目的:分析5例Gitelman综合征(Gitelman syndrome,GS)患者的临床表现,并从基因水平探讨相关疾病的遗传学特点和基因突变特点。本研究另对2例临床诊断为低钾血症患者进行临床资料收集及相关基因二代测序,明确是否携带SLC12A3基因突变。材料和方法:本研究纳入样本分别为来自2017年至2019年期间苏州大学附属第一医院内分泌科收治的5例临床诊断为Gitelman综合征的患者及其家系,另纳入2例临床诊断为低钾血症的患者。收集患者的一般临床资料和相关的实验室检查结果,并留取患者及家系外周血DNA样本,应用二代测序技术对标本进行遗传性疾病相关基因测序,查找等位基因频率、致病性报道,并通过SIFT、Polyphen2、Mutation taster软件对错义突变进行基因功能预测,通过ScSNV、SPIDEX、MaxEntScan软件对剪切位点突变进行基因功能预测,依据ACMG变异分类标准进行基因变异分类,通过ProtParam软件进行基因表达产物理化性质分析,通过Swiss-Pdb Viewer软件对蛋白三维结构模型进行对比分析。结果:在5例纳入本研究的临床诊断为Gitelman综合征的患者中,男性2例,女性3例,均足月出生,临床表现为反复乏力、疲劳,顽固低钾血症,低镁血症,不适当的肾钾排泄增多,代谢性碱中毒,低钙尿,高血浆肾素水平等。纳入本研究的临床诊断为低钾血症患者2例,均为男性,也有反复乏力症状,但无其他Gitelman综合征的临床特征。在上述5例临床诊断为GS患者中均发现了 SLC12A3基因突变,共发现了 8个相关的突变位点,均为复合杂合突变,其中错义突变7个(Asn958Lys、Arg964Gln、Asp486Asn、Thr60Met、Leu891Val、Arg1018Gln、Arg334Trp),剪切位点变异 1 个(c.2660+1G>A)。有2例患者均携带突变Asp486Asn,有2例患者均携带突变Leu891Val。另外2例临床诊断为低钾血症患者基因检测结果为阴性。错义突变Asn958Lys在各数据库中未收录,其他突变均为正常人群中极低频率的变异。其中突变Asn958Lys为新发现突变,其致病性尚未见文献报道,其他突变的致病性均有文献报道。各错义突变的功能预测示,Asn958Lys仅在Mutation taster中被预测为Disease causing(致病);Arg964Gln 在 SIFT 中被预测为 Deleterious(有害),在 Mutation taster中被预测为 Disease causing(致病);其他突变在 SIFT、Polyphen2、Mutation taster中均分别被预测为Deleterious(有害)、Probably damaging(很可能有害)和Disease causing(致病)。剪切位点突变的功能预测示,突变c.2660+1G>A在ScSNV、SPIDEX、MaxEntScan中均被预测将会影响基因正确表达。按照ACMG变异分类标准,变异Asn958Lys、Arg964Gln、Arg1018Gln均归类为 likely pathogenic variants(可疑病理性变异);变异 Asp486Asn、c.2660+1G>A、Thr60Met、Arg334Trp、Leu891Val 均归类为 pathogenic variants(病理性变异)。ProtParam软件对基因表达产物的理化性质分析表明,以上突变均可导致突变NCCT的理化性质发生改变。Swiss-PdbViewer软件对蛋白三维结构模型进行对比分析表明,以上突变均可导致NCCT三维结构的改变。结论:本研究强调了二代测序在内分泌系统罕见病Gitelman综合征分子诊断中的临床价值,提示将SLC12A3基因检测纳入基因检测小组可能有助于Gitelman综合征的早期诊断和高诊断成功率,为临床诊断和治疗、遗传咨询及产前诊断提供依据。
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