党的十九大报告强调实施创新驱动发展战略,创新逐渐成为引领经济发展的第一动力,建设创新型国家成为顺应时代发展的重要举措。大学科技园、高新开发区是国家创新体系的重要组成部分,大学科技园与高新区既有功能上的互补性,又有空间上的临近性,两者的交流合作、强强联合、协同创新,大学科技园与高新区的协同创新是一种独特的、系统的、持久的组织关系。首先,本文梳理了大学科技园与高新开发区协同创新相关文献,对大学科技园及高新开发区协同创新的研究现状进行归纳总结,并对协同过程涉及的协同、博弈、委托代理等理论进行论述。在此基础上分析大学科技园与高新开发区的运行模式,从大学科技园的发展模式与高新开发区的发展模式入手,探索大学科技园与高新开发区的可能发展模式。研究发现协同创新是一个持久的过程,每个协同创新主体会随着利益的分配、政策环境、资源等因素不断的修正自己的行为,以便与其他创新主体达成稳定的协同创新关系。演化博弈模型能够描述动态的修正过程,因此,从博弈的角度构建大学科技园与高新开发区协同创新的演化博弈模型,研究表明创新主体均选择协同时为最优稳定策略且利益分配对稳定策略的选择至关重要。基于对创新主体的利益博弈关系分析,建立大学科技园与高新开发区协同创新的委托代理模型。从信息对称与不对称的情况出发,以整体收益最大化为决策原则,构建大学科技园与高新区协同创新的委托代理利益分配模型,分别确定最优努力水平和最优协同创新程度,在此基础上确定最优分配比例。研究表明,协同创新效益、努力程度、创新投入等对利益分配有正向作用。监督水平、信息可观测度等对利益分配比例有负向作用。最后,给出了提高协同创新水平的一些政策建议,包括建立知识共享平台、完善政府的政策环境、建立合理的协同创新机制和监督机制等。